[发明专利]金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物、探针及方法建立在审
申请号: | 201810599552.7 | 申请日: | 2018-06-12 |
公开(公告)号: | CN108570512A | 公开(公告)日: | 2018-09-25 |
发明(设计)人: | 黄梅清;郑敏;陈秀琴;蔡羲;吴南洋 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/10;C12Q1/04;C12Q1/14;C12N15/11;C12R1/19;C12R1/445;C12R1/42 |
代理公司: | 长沙星耀专利事务所(普通合伙) 43205 | 代理人: | 许伯严 |
地址: | 350013 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 金黄色葡萄球菌 沙门氏菌 大肠杆菌 探针 引物 荧光定量PCR检测 大肠杆菌O157 沙门氏菌invA 生物检测技术 荧光定量PCR 灵敏度 | ||
1.金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针,其特征在于,包括分别以金黄色葡萄球菌nuc基因、大肠杆菌O157:H7wzx基因、沙门氏菌invA基因为对象的三组引物和探针,所述三组引物和探针分别具有以下碱基对:
以金黄色葡萄球菌nuc基因为对象:
上游引物(5’-3’)TTGTAGTTTCAAGTCTAAGTAGCTCAGC
下游引物(5’-3’)TTGCACTATATACTGTTGGATCTTCAG
探针(5’-3’)FAM-TGCATCACAAACAGATAACGGCGTAAATAG-BHQ1;
以大肠杆菌0157:H7wzx基因为对象:
上游引物(5’-3’)TCATGCACGCAATGATACTCAA
下游引物(5’-3’)CGAACACTACTAATATGAAGGCCA
探针(5’-3’)CY5-AGACGCTCAGAACATCATTGAAAATAGTGGG-BHQ2;
以沙门氏菌invA基因为对象:
上游引物(5’-3’)CCTGATCGCACTGAATATCGTACT
下游引物(5’-3’)GTGGTAATTAACAGTACCGCAGGA
探针(5’-3’)Vic-ATATTGGTGTTTATGGGGTCGTTCTACATTGAC-BHQ1。
2.权利要求1所述的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌0157:H7、沙门氏菌三重荧光定量PCR方法的建立中的应用,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一:设计所述三组引物和探针;
步骤二:引物特异性检测;
步骤三:金黄色葡萄球菌nuc基因、大肠杆菌O157:H7wzx基因、沙门氏菌invA基因的克隆及质粒提取鉴定;
步骤四:对金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、大肠杆菌分别进行探针单重特异性测定;
步骤五:探针法多重特异性检测;
步骤六:多重条件探索;
步骤七:标准曲线建立。
3.根据权利要求2所述的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌0157:H7、沙门氏菌三重荧光定量PCR方法的建立中的应用,其特征在于,步骤二中所述引物特异性检测时,
PCR体系如下:
PCR反应条件如下:
大肠杆菌0157:H7和沙门氏菌的PCR反应条件:
金黄色葡萄球菌的PCR反应条件:
4.根据权利要求2所述的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌0157:H7、沙门氏菌三重荧光定量PCR方法的建立中的应用,其特征在于,步骤四中所述单重特异性测定时,
qPCR体系如下:
qPCR条件如下:50℃,2min;95℃,5min;(95℃,40s;60℃,40s;)×40个循环。
5.根据权利要求2所述的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌0157:H7、沙门氏菌三重荧光定量PCR方法的建立中的应用,其特征在于,步骤五中所述探针法多重特异性检测时,将金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、大肠杆菌放在同一个体系进行扩增,qPCR体系如下:
6.根据权利要求2所述的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌0157:H7、沙门氏菌三重荧光定量PCR方法的建立中的应用,其特征在于,步骤六中所述多重条件探索时,Mix固定30μL,探针设3个浓度(0.4μL、0.3μL、0.2μL),最终选定探针浓度为0.4μL;探针固定为0.4μL,mix设30μL、40μL、mix 35μL,最终选定mix浓度为30μL。
7.根据权利要求2所述的金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌三重荧光定量PCR检测的引物和探针在金黄色葡萄球菌、大肠杆菌0157:H7、沙门氏菌三重荧光定量PCR方法的建立中的应用,其特征在于,步骤七中建立的标准曲线为:
金黄色葡萄球菌:Y=-4.929X+58.824 R2=0.999 Eff%=86.721
沙门氏菌:Y=-4.74X+57.046 R2=0.996 Eff%=90.775
大肠杆菌O157H7:Y=-4.277X+52.119 R2=0.997 Eff%=84.861。
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