[发明专利]一种个体化用药基因检测试剂盒及应用有效
申请号: | 201810600578.9 | 申请日: | 2018-06-12 |
公开(公告)号: | CN108707658B | 公开(公告)日: | 2019-09-17 |
发明(设计)人: | 糜庆丰;向书芹;钟婉平;郭怿盈;吴春求;黄铨飞;刘丽菲 | 申请(专利权)人: | 东莞博奥木华基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/6806;C40B50/06 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 许飞 |
地址: | 523808 广东省东莞市松山湖高新技*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 个体化用药 基因检测试剂盒 测序 扩增 多态性位点 药物基因 引物组 建库 应用 多重PCR反应 非特异性 含量差异 基因检测 特异性强 样本类型 引物序列 覆盖度 干血片 均一性 扩增子 试剂盒 一次性 全血 拭子 引物 成功率 口腔 检测 | ||
1.一种个体化用药基因检测试剂盒,具有用于扩增下表所示110个药物基因多态性位点的引物,
所述引物序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:186所示。
2.根据权利要求1所述的个体化用药基因检测试剂盒,其特征在于:所述引物的5’端连接有核酸测序文库构建所需的通用序列。
3.根据权利要求1或2所述的个体化用药基因检测试剂盒,其特征在于:所述引物的混合配比如权利要求1中各引物的pooling系数所示。
4.根据权利要求1或2所述的个体化用药基因检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括测序接头、测序标签接头、多重PCR缓冲液、DNA聚合酶、DMSO。
5.一种个体化用药基因检测引物组,为权利要求1~4任一项所述的试剂盒中包括的引物。
6.一种个体化用药基因检测的核酸测序文库构建方法,包括如下步骤:利用权利要求1~4任一项所述的试剂盒或权利要求5所述的引物组,根据所用的核酸测序平台,构建扩增子文库,将扩增子文库混合纯化后,用于核酸测序。
7.根据权利要求6所述的核酸测序文库构建方法,其特征在于:所述核酸测序平台包括Ion torrent平台、Illumina平台、Roche454平台、SoLID平台、BioelectronSeq 4000测序平台。
8.根据权利要求6所述的核酸测序文库构建方法,其特征在于:所述方法进一步包括步骤:利用5’端连接有通用序列的引物组,3’端连接有通用序列的测序接头和3’端连接有通用序列的测序标签接头,进行一步多重PCR扩增,获得扩增子文库,将扩增子文库混合纯化后,用于Ion torrent测序。
9.根据权利要求8所述的核酸测序文库构建方法,其特征在于:一步多重PCR扩增的25μL体系为:样本DNA 80~200ng、引物组0.6μL、测序接头0.25μL、测序标签接头0.25μL、2X多重PCR缓冲液12.5μL、0.8~1.2U/μLDNA聚合酶、DMSO 1.5%~8%(V/V)、无核酸酶水为余量。
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