[发明专利]一株对革兰阳性耐药菌具有广谱抗菌活性的人葡萄球菌及其筛选方法和应用

说明书

本发明公开一株对革兰阳性耐药菌具有广谱抗菌活性的人葡萄球菌及其筛选方法，该人葡萄球菌分离于健康人皮肤定植的人葡萄球菌菌株，命名为S34‑1，对临床常见的革兰阳性耐药病原菌均有明显抑菌作用，但对革兰阴性耐药菌无抑菌作用。该人葡萄球菌株S34‑1基因组大小为2195430bp，包含2个质粒，大小分别为29577bp和29535bp，其已于2018年04月03日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC)，其保藏编号为CGMCC No.15552。本发明还涉及该人葡萄球菌S34‑1在制备抗革兰阳性耐药菌药物中的应用。本发明从人体共生/定植菌群中筛选到对临床常见耐药病原菌有广谱抗菌活性的菌株，为挖掘对人体低毒无害、结构全新、不易产生耐药、针对性更强的新型抗菌分子打下基础。

技术领域

本发明涉及微生物动物细胞系领域，尤其涉及一株对革兰阳性耐药菌具有广谱抗菌活性的人葡萄球菌及其筛选方法。

背景技术

多重耐药菌感染已经成为全球棘手的公共健康议题。2017年WHO发布12种临床耐药菌的全球警告，碳青霉烯类抗生素耐药肠杆菌科细菌(CRE)、万古霉素耐药肠球菌(VRE)及甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)等都是临床抗感染治疗最棘手的病原类型。大多数现有的抗生素来源于环境(土壤等)微生物的代谢产物，但环境微生物这一有限资源在上世纪六十年代已被最大程度的挖掘。随着近几年对人体微生物组学研究进展，研究者开始关注于和人类共适应、共进化数百万年的人体共生菌/定植菌群，约100万亿个细菌组成的人体共生菌影响人体的健康。人体不同部位的共生菌群构成了抵御病原体入侵的第一道防线，能够与病原体竞争营养、阻止病原体粘附定植，分解和吸收宿主无法消化的碳水化合物，合成分泌宿主必须的维生素，对肠道黏膜免疫和机体免疫系统都产生动态而持久的影响。尤为重要的是人体共生菌群能产生作用于人体和环境细胞的特有代谢产物，其中一种即为抗菌分子，它能够抑制其他细菌在该部位的定植和入侵，为产生菌提供了必要的竞争优势。

人体皮肤和上呼吸道是抵御外来病原微生物入侵的第一道防线，皮肤和上呼吸道定植的菌群以凝固酶阴性葡萄球菌(Coagulase negative Staphylococcus，CNS)为主，包括人葡萄球菌、人葡萄球菌、头状葡萄球菌、沃氏葡萄球菌及路登葡萄球菌等。CNS的存在对维持皮肤和上呼吸道正常的生理功能及免受其他病原微生物的入侵具有重要意义。

目前，均未有报道人葡萄球菌与抗革兰阳性耐药菌之间具有关联性的相关文献。

发明内容

本发明的目的是从人体共生/定植菌群中筛选到对临床常见耐药病原菌有广谱抗菌活性的菌株，具体涉及一株分离于健康人皮肤表面定植的人葡萄球菌菌株，该菌株产生的抗菌分子对临床常见革兰阳性耐药菌具有广谱抗菌活性。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明的第一个目的是提供一株对革兰阳性耐药菌具有广谱抗菌活性的人葡萄球菌，所述人葡萄球菌的大小为2195430bp，G+C含量为50％，含有7个前噬菌体，3个基因组岛以及2个质粒，其中所述质粒的大小分别为29577bp和29535bp。

进一步地，所述人葡萄球菌命名为S34-1，其分类命名为人葡萄球菌(Staphylococcus hominis)，其保藏编号为CGMCC No.15552，保藏日期为2018年04月03日，保藏单位为中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC)，保藏单位地址为北京市朝阳区北辰西路1号院，中国科学院微生物研究所。

进一步地，所述革兰阳性耐药菌包括：甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌、耐大环内酯类抗生素的肺炎链球菌、耐万古霉素的屎肠球菌。

进一步地，所述甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌包括社区获得性甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)、医院获得性甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(HA-MRSA)、家畜来源甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(LA-MRSA)。