[发明专利]适用于单分子测序的设备及对核酸分子进行测序的方法

权利要求书

1.一种适用于单分子测序的设备，其特征在于，包括：

至少一个纳米井，其中所述至少一个纳米井具有观察区；

多个核酸固定部分，设置在所述观察区中或邻近所述观察区；

多种类型的核酸片段，分别被固定到所述多个核酸固定部分；以及

至少一个聚合酶，设置在所述观察区中。

2.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述观察区的直径介于10nm到500nm范围内，且所述观察区的高度小于200nm。

3.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述多种类型的核酸片段是直线型核酸片段。

4.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述多种类型的核酸片段在长度上包括50个核苷酸到200个核苷酸。

5.根据权利要求4所述的设备，其特征在于，所述至少一个聚合酶为一个聚合酶。

6.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述多种类型的核酸片段在长度上包括多于200个核苷酸。

7.根据权利要求6所述的设备，其特征在于，所述至少一个聚合酶包括多个聚合酶，所述设备还包括位于所述观察区中的多个聚合酶固定部分，且所述多个聚合酶被固定到所述多个聚合酶固定部分。

8.一种对核酸分子进行测序的方法，其特征在于，包括：

(a)提供至少一个纳米井，其中所述至少一个纳米井具有观察区；

(b)将多种类型的核酸片段通过多个核酸固定部分固定到所述观察区；

(c)向所述至少一个纳米井中提供一个引物及多个经标记核苷酸，其中所述引物与所述多种类型的核酸片段中的一者在所述观察区中形成引物-核酸片段复合体；以及

(d)通过使用聚合酶并将所述多个经标记核苷酸纳入到所述引物-核酸片段复合体中来起始所述引物-核酸片段复合体的新生链合成反应,以形成新生链；以及

(e)通过检测经纳入后所述多个经标记核苷酸的序列来确定所述多种类型的核酸片段的序列。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，还包括以下步骤：

(f)将所述新生链离解；以及

(g)重复步骤(c)到步骤(f)。

10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述观察区的直径介于10nm到500nm之间，且所述观察区的高度小于200nm。

11.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述多种类型的核酸片段在长度上包括50个核苷酸到200个核苷酸。

12.根据权利要求11所述的方法，其特征在于，步骤(c)还包括添加所述聚合酶。

13.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述多种类型的核酸片段在长度上包括多于200个核苷酸。

14.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，还包括将多个聚合酶通过多个聚合酶固定部分固定到所述观察区，其中在步骤(d)中使用的所述聚合酶是所述多个聚合酶中的一者。

15.根据权利要求14所述的方法，其特征在于，所述固定所述多个聚合酶的步骤是在步骤(c)之前执行。

16.根据权利要求14所述的方法，其特征在于，还包括以下步骤：

(f)将所述新生链离解；以及

(g)重复步骤(c)到步骤(f)，其中在所重复的步骤(d)中使用的所述聚合酶是所述多个聚合酶中的一者。