[发明专利]一种检测痕量单链DNA片段的方法在审

专利信息
申请号: 201810613310.9 申请日: 2018-06-14
公开(公告)号: CN108588197A 公开(公告)日: 2018-09-28
发明(设计)人: 陆骊工;刘少卿;占美晓;李勇;何旭;忻勇杰;肖静 申请(专利权)人: 珠海市人民医院
主分类号: C12Q1/686 分类号: C12Q1/686
代理公司: 南京中律知识产权代理事务所(普通合伙) 32341 代理人: 沈振涛
地址: 519000 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 粘性末端 富集 单链DNA片段 目标DNA片段 捕获目标 目标DNA 种检测 痕量 分子生物学检测 操作流程 产物纯化 文库构建 芯片杂交 样品制备 荧光免疫 起始量 捕获
【权利要求书】:

1.一种检测痕量单链DNA片段的方法,其特征在于:包括以下步骤:

(1)设计粘性末端Adapter对,包括Adapter L和Adapter R;其中,Adapter L用于捕获目标单链DNA片段的5`端,Adapter R用于捕获目标单链DNA片段的3`端;

(2)向含目标单链DNA片段的样品中加入粘性末端Adapter对反应,在DNA Ligase的作用下,Adapter对与目标单链DNA片段的粘性末端连接;

(3)步骤(2)产物纯化后,通过PCR扩增即得富集后的目标单链DNA片段。

2.根据权利要求1所述的一种检测痕量单链DNA片段的方法,其特征在于:包括以下步骤:

(1)使用核酸检测仪对单链DNA片段进行质控;

(2)向PCR管中加入1ul质控后的单链DNA片段,再加入反应试剂,在PCR仪中20-37℃下反应30min,反应试剂为:

反应试剂体积
含单链DNA片段的样品20ul
T4 Polymerase Buffer(10x)2.5ul
T4 PNK2ul
T4 DNA Ligase Buffer(10x)2.5ul
T7 DNA Ligase1ul
Adapter L2.5ul
Adapter R2.5ul
加至50ul

(3)步骤(2)的产物用1.8倍体积的AMPure XP beads进程纯化,回溶在23ul的水中;再加入PCR反应体系,在PCR仪中循环反应;

其中,PCR反应体系为:

循环反应程序为:95℃,45s;进入循环:98℃,20s;55℃,30s;72℃,30s,共25个循环;72℃,1min;4℃,∞;

(4)步骤(3)的产物用1.8倍体积的AMPure XP beads进程纯化,即可。

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