[发明专利]一种检测痕量单链DNA片段的方法在审
申请号: | 201810613310.9 | 申请日: | 2018-06-14 |
公开(公告)号: | CN108588197A | 公开(公告)日: | 2018-09-28 |
发明(设计)人: | 陆骊工;刘少卿;占美晓;李勇;何旭;忻勇杰;肖静 | 申请(专利权)人: | 珠海市人民医院 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
代理公司: | 南京中律知识产权代理事务所(普通合伙) 32341 | 代理人: | 沈振涛 |
地址: | 519000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 粘性末端 富集 单链DNA片段 目标DNA片段 捕获目标 目标DNA 种检测 痕量 分子生物学检测 操作流程 产物纯化 文库构建 芯片杂交 样品制备 荧光免疫 起始量 捕获 | ||
1.一种检测痕量单链DNA片段的方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)设计粘性末端Adapter对,包括Adapter L和Adapter R;其中,Adapter L用于捕获目标单链DNA片段的5`端,Adapter R用于捕获目标单链DNA片段的3`端;
(2)向含目标单链DNA片段的样品中加入粘性末端Adapter对反应,在DNA Ligase的作用下,Adapter对与目标单链DNA片段的粘性末端连接;
(3)步骤(2)产物纯化后,通过PCR扩增即得富集后的目标单链DNA片段。
2.根据权利要求1所述的一种检测痕量单链DNA片段的方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)使用核酸检测仪对单链DNA片段进行质控;
(2)向PCR管中加入1ul质控后的单链DNA片段,再加入反应试剂,在PCR仪中20-37℃下反应30min,反应试剂为:
反应试剂 体积 含单链DNA片段的样品 20ul T4 Polymerase Buffer(10x) 2.5ul T4 PNK 2ul T4 DNA Ligase Buffer(10x) 2.5ul T7 DNA Ligase 1ul Adapter L 2.5ul Adapter R 2.5ul 水 加至50ul
(3)步骤(2)的产物用1.8倍体积的AMPure XP beads进程纯化,回溶在23ul的水中;再加入PCR反应体系,在PCR仪中循环反应;
其中,PCR反应体系为:
循环反应程序为:95℃,45s;进入循环:98℃,20s;55℃,30s;72℃,30s,共25个循环;72℃,1min;4℃,∞;
(4)步骤(3)的产物用1.8倍体积的AMPure XP beads进程纯化,即可。
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