[发明专利]与猪经产产仔数相关的SNP分子标记、鉴定及其应用有效
申请号: | 201810613697.8 | 申请日: | 2018-06-14 |
公开(公告)号: | CN108893544B | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
发明(设计)人: | 杨亚岚;李奎;周荣;刘颖;李文通;李华;于辉 | 申请(专利权)人: | 佛山科学技术学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;G01N33/573 |
代理公司: | 北京康思博达知识产权代理事务所(普通合伙) 11426 | 代理人: | 刘冬梅;孙建玲 |
地址: | 528000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 猪经产 产仔 相关 snp 分子 标记 鉴定 及其 应用 | ||
1.一种与猪经产产仔数相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记位于猪参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:75245594,NCBI参考SNP编号为rs701332503,该SNP位点的两种等位基因为C和T。
2.根据权利要求1所述的分子标记,其特征在于,所述SNP位点对应的三种基因型分别为CC、TT和TC基因型,基因型为CC的猪相较于基因型为TT和TC的猪有更高的经产产仔数。
3.根据权利要求1所述的分子标记,其特征在于,用以检测所述SNP位点基因分型的方法中涉及PCR扩增反应,PCR扩增反应中扩增引物P1和P2的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
4.根据权利要求1所述的分子标记,其特征在于,用以检测所述SNP位点基因分型的方法中涉及单碱基延伸反应,单碱基延伸反应中延伸引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
5.根据权利要求1所述的分子标记,其特征在于,用以检测所述SNP位点的试剂盒由一组扩增引物P1和P2、延伸引物、PCR反应试剂和PCR产物纯化试剂组成,
所述扩增引物P1和P2的核苷酸序列分别包括SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列;
所述延伸引物的核苷酸序列包括SEQ ID NO.3所示序列。
6.一种鉴定或辅助鉴定猪经产产仔数的方法,其特征在于,所述方法包括检测猪参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:75245594处脱氧核糖核苷酸为C或T,以确定待测猪该SNP位点处的基因型是CC、TT或TC的步骤,根据基因型确定猪经产产仔数的高低:基因型为CC的猪相较于基因型为TT或TC的猪有更高的经产产仔数,
猪参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:75245594处SNP位点的NCBI参考编号为rs701332503,
其中,CC基因型为猪该SNP位点的脱氧核糖核苷酸为C的纯合体;TT基因型为该SNP位点的脱氧核糖核苷酸为T的纯合体;TC基因型为猪该SNP位点的脱氧核糖核苷酸为T和C的杂合体。
7.一种高经产产仔数猪的育种方法,其特征在于,所述方法包括选择参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:75245594处基因型为CC的猪作为亲本进行育种的步骤,
其中,猪参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:75245594处SNP位点的NCBI参考编号为rs701332503。
8.根据权利要求7所述的育种方法,其特征在于,所述育种方法还包括通过测定猪卵巢组织中DHRS4基因mRNA的表达量,判定经产产仔数的高低;
其中,猪卵巢组织中DHRS4基因mRNA的表达量越低,猪有较高的经产产仔数,mRNA的表达量越高,猪有较低的经产产仔数。
9.根据权利要求7所述的育种方法,其特征在于,所述育种方法还包括通过测定猪卵巢组织中DHRS4基因编码的NRDR蛋白的表达量,判定经产产仔数的高低;
其中,NRDR蛋白的表达量越低,猪有较高的经产产仔数,NRDR蛋白的表达量越高,猪有较低的经产产仔数。
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