[发明专利]一种同步检测猪五种繁殖障碍性病毒病多重PCR体系及检测方法在审
申请号: | 201810645013.2 | 申请日: | 2018-06-21 |
公开(公告)号: | CN108753936A | 公开(公告)日: | 2018-11-06 |
发明(设计)人: | 李文刚;刘胜利;吕玉金;刘玲玲;吴凤笋;马文涛 | 申请(专利权)人: | 河南牧业经济学院 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/70;C12N15/11 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 谈杰 |
地址: | 450046 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多重PCR 多重PCR反应 检测 繁殖障碍 同步检测 性病 验证 临床样品检测 提取病毒DNA 特异性引物 反应程序 经费开支 临床样品 常规PCR 反转录 扩增 引物 微生物 诊断 节约 保留 试验 应用 优化 | ||
1.一种同步检测猪五种繁殖障碍性病毒病多重PCR体系的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)PPV和PCV2病毒DNA的提取;
2)CSFV、PRRSV和JEV病毒RNA的提取以及反转录;
3)特异性引物设计与筛选;
4)对步骤3)所设计的特异性引物进行PCR反应条件优化,从而建立最佳多重PCR反应体系;
5)按照步骤4)建立的最佳多重PCR反应体系进行多重PCR扩增特异性验证;
6)按照步骤4)建立的最佳多重PCR反应体系进行多重PCR敏感性验证;
7)按照步骤4)建立的最佳多重PCR反应体系进行多重PCR稳定性验证;
8)按照建立的多重PCR方法对临床样品的检测,以验证该方法的可行性。
2.根据权利要求1所述的一种同步检测猪五种繁殖障碍性病毒病多重PCR体系的检测方法,其特征在于,步骤1)所述的PPV和PCV2病毒DNA的提取方法为:取适量PPV和PCV2病毒液,置于1.5mL Eppendorf管中,参照上海生物工程的DNA提取试剂盒说明书进行,将提取的基因组DNA置于-20℃保存备用。
3.根据权利要求1所述的一种同步检测猪五种繁殖障碍性病毒病多重PCR体系的检测方法,其特征在于,所述步骤2)中,CSFV、PRRSV、JEV病毒RNA的提取及反转录方法为:取CSFV、PRRSV和JEV病毒液,参照Magen公司Hipure Viral RNA Spin Kit试剂盒说明书提取病毒RNA,将提取的病毒RNA反转录成cDNA,按照Magen公司M-MLV H-First-StandSynthesis Kit反转录试剂盒说明书进行,将反转录的cDNA置于-20℃保存备用。
4.根据权利要求1所述的一种同步检测猪五种繁殖障碍性病毒病多重PCR体系的检测方法,其特征在于,步骤3)中所述特异性引物的设计与筛选具体为:应用生物学软件对CSFV、PPV、PRRSV、JEV和PCV2基因进行同源性分析,筛选确定引物,确保所设计引物必须为特异性引物,一对引物只能扩增出相应病毒的序列片段,并且与其它引物之间没有干扰,即没有同源、互补,不形成发卡结构;所述设计的引物序列为:
CSFV的特异性引物:
F:5′-TGCAACTGAATGACGGGAC-3′
R:5′-GCCAAATACCTCCTACTGACCAC-3′
PPV的特异性引物:
F:5′-AAAAACAATCCACCAGGACAAC-3′
R:5′-CTGGATCTCATTTTTGCTGTGA-3′
PRRSV的特异性引物:
F:5′-CGGGCGGTATGTCCTAAGTA-3′
R:5′-ACCTCAACTTTGCCCCTTTT-3′
JEV的特异性引物:
F:5′-AGCTTGTTGGACGGCAGAG-3′
R:5′-GCCACATGATTGAGCCTTCA-3′
PCV2的特异性引物:
F:5′-CTATCAAGCGAACCACAGT-3′
R:5′-GGTCTACATTTCCAGCAGT-3′。
5.根据权利要求1所述的一种同步检测猪五种繁殖障碍性病毒病多重PCR体系的检测方法,其特征在于,所述步骤4)中所述的PCR反应条件优化具体方法为:选择25μL的PCR反应体系,体系包含10×PCR buffer(Mg2+Plus)2.5μL,2.5mmol/L dNTP 3.0μL,5U/μL Taq聚合酶0.4μL,DNA与cDNA混合模板2.0μL,上下游引物浓度为10μmol/L,ddH2O补足至25μL,根据多重PCR条带的明暗度,适当调整3对引物加入量的比例;退火温度根据引物Tm值范围进行,根据梯度PCR仪将退火温度设定为49.5℃、50.8℃、51.7℃、54.1℃、56.6℃、57.8℃、58.7℃、59.5℃、60.0℃,同时对循环次数的条件在单一变量的情况下进行优化,最终确定最佳多重PCR反应体系及反应程序,循环次数按照为20、30、35、40设置。
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