[发明专利]一种β-酪蛋白基因分型的HRM检测方法及引物在审
申请号: | 201810660317.6 | 申请日: | 2018-06-25 |
公开(公告)号: | CN108823321A | 公开(公告)日: | 2018-11-16 |
发明(设计)人: | 耿晓晖;殷臣胤 | 申请(专利权)人: | 北京向中生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市安伦律师事务所 11339 | 代理人: | 郭扬;韩景漫 |
地址: | 100084 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | β -酪蛋白基因 检测 引物 样本DNA 基因型 分型 高通量检测 酪蛋白基因 扩增产物 上游引物 收集数据 下游引物 引物序列 酪蛋白 分析 | ||
1.一种用于β-酪蛋白基因分型的HRM检测的引物,其特征在于,所述引物序列如下:
上游引物:5’-ATC CAC CCC TTT GCC CAG AC-3’,
下游引物:5’-GGG GTT TGA GTA AGA GGA GGG-3’。
2.一种β-酪蛋白基因分型的HRM检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(A)提取样本DNA;
(B)对所述样本DNA采用如权利要求1所述的引物进行PCR扩增;
(C)对PCR扩增产物进行HRM检测,收集数据,确定扩增产物基因型。
3.根据权利要求2所述的β-酪蛋白基因分型的HRM检测方法,其特征在于,所述步骤(B)中PCR扩增反应按以下步骤进行:
(1)95℃2分钟;
(2)95℃10秒,60℃30秒,共进行40个循环。
4.根据权利要求2所述的β-酪蛋白基因分型的HRM检测方法,其特征在于,所述步骤(B)中PCR扩增是在反应液中进行的,其中20μl的反应液由以下组分组成:
2X HRM Analysis Premix:10μl;
10μM的上游引物:0.6μl;
10μM的下游引物:0.6μl;
50ng/μl的DNA模板:1μl;
RNase-Free ddH2O:补齐至20μl,
其中,所述2X HRM Analysis Premix包括500μM dNTP、0.1U DNA聚合酶、饱和荧光染料、20mM Tris-HCl、100mM KCl及3mM MgCl2。
5.根据权利要求4所述的β-酪蛋白基因分型的HRM检测方法,其特征在于:所述饱和荧光染料为Eva Green染料。
6.根据权利要求2所述的β-酪蛋白基因分型的HRM检测方法,其特征在于,所述步骤(C)中对PCR扩增产物进行HRM分析的产物熔解过程为:95℃保持10秒,降到40℃保持10秒,之后从40℃升温熔解至85℃,熔解速率为0.05℃/秒,升温至85℃后保持1秒,之后降至40℃保持30秒;在从40℃升温熔解至85℃的过程中实时检测信号,信号检测频率为12次/℃。
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