[发明专利]一种HLA-B*1502基因的检测方法及检测试剂盒在审

专利信息
申请号: 201810668248.3 申请日: 2018-06-26
公开(公告)号: CN109112188A 公开(公告)日: 2019-01-01
发明(设计)人: 王文忠;胡军;田军龙;陈苏平;卜云璇 申请(专利权)人: 苏州道尔盾基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12Q1/6883
代理公司: 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 代理人: 韩飞
地址: 215000 江苏省苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基因 检测试剂 检测 特异性引物 单碱基延伸反应 特异性PCR扩增 分析目标基因 限制性内切酶 实验自动化 质谱仪检测 基因设计 基因序列 目的片段 人员操作 实验流程 脱盐纯化 核酸 扩增 通量 重性 消化
【说明书】:

发明涉及一种HLA‑B*1502基因的检测方法及检测试剂盒。所述检测方法包括如下步骤:(1)针对HLA‑B*1502基因设计特异性引物;(2)利用特异性PCR扩增包含HLA‑B*1502基因的目的片段;(3)利用限制性内切酶消化PCR产物片段;(4)进行单碱基延伸反应;(5)进行脱盐纯化处理;(6)通过核酸质谱仪检测分析目标基因HLA‑B*1502的基因序列。上述HLA‑B*1502基因的检测方法,检测准确性高、实验可重性高、通量大、成本低。本发明还提供了一种HLA‑B*1502基因的检测试剂盒,包括用于扩增HLA‑B*1502基因的特异性引物对。上述HLA‑B*1502基因的检测试剂盒,简化了实验流程,人员操作时间短、难度小,实验自动化程度高。

技术领域

本发明涉及生物检测技术领域,特别是涉及一种HLA-B*1502基因的检测方法及检测试剂盒。

背景技术

卡马西平(carbamazepine)别名氨甲酰苯卓、氨甲酰苯卓、氨甲酰氮卓等,是一种用于治疗癫痫、外周神经痛、神经源性尿崩症,预防或治疗躁狂抑郁症的药物。卡马西平常见的副作用主要有:神经系统损害、造血系统损害、肝肾损害、胃肠道损害和皮肤损害。在美国,卡马西平用于治疗癫痫、躁狂/抑郁症和神经病理性疼痛。美国食品药品监督管理局(FDA)发布关于卡马西平的安全性信息,信息称,卡马西平会引起危险的甚至致命的皮肤反应(史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死溶解症),尤其在含人白细胞抗原等位基因HLA- B*1502的患者中更容易发生。史蒂文斯-约翰逊综合征(Stevens Johnson syndrome,SJS)和中毒性表皮坏死溶解症(toxic epidermal necrolysis,TEN)是严重的皮肤和粘膜反应,可导致永久性残疾甚至致命。卡马西平导致SJS/TEN的几率很低,在白种人国家进行的针对卡马西平导致SJS/TEN的整体评估显示,S JS/TEN发生率只有万分之一至万分之六。但根据世界卫生组织(WHO)和卡马西平制药商收到的上市药品不良事件报告显示,一些亚洲国家出现SJS/TEN的概率大约要高出10倍。中国台湾、欧洲和中国香港的研究显示,SJS/TEN风险的增加与HLA-B*1502有关。几乎仅亚洲血统患者携带HLA-B*1502等位基因,包括南亚的印度人。HLA-B*1502可以通过遗传测试检测。携带HLA-B*1502 基因的患者在开始使用卡马西平治疗之前,应进行HLA-B*1502等位基因检测,如经检测结果呈阳性,则不宜使用卡马西平,除非药品的预期收益明显大于严重皮肤反应风险的增加。研究发现,在HLA-B基因座附近存在与某些亚型高度连锁的SNP,即“标签SNP”,HLA-B*1502的标签SNP是rs10484555的C等位基因,二者的特异性可达99.27%。因此,通过检测标签SNP来检测样本的H LA-B的基因型是一种新的研究方向。本发明旨在对患者展开rs10484555多态性筛查,为此类患者开展个性化精准诊治奠定临床及科研基础。

发明内容

基于此,有必要针对通过检测标签SNP来检测样本的HLA-B的基因型这一研究方向,提供HLA-B*1502基因的检测方法及检测试剂盒。

一种HLA-B*1502基因的检测方法,所述检测方法包括如下步骤:

(1)针对HLA-B*1502基因设计特异性引物;

(2)利用特异性PCR扩增包含HLA-B*1502基因的目的片段;

(3)利用限制性内切酶消化PCR产物片段;

(4)进行单碱基延伸反应;

(5)进行脱盐纯化处理;

(6)通过核酸质谱仪检测分析目标基因HLA-B*1502的基因序列。

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