[发明专利]一种人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201810669169.4 申请日: 2018-06-26
公开(公告)号: CN108977499A 公开(公告)日: 2018-12-11
发明(设计)人: 王文忠;胡军;田军龙;陈苏平;卜云璇 申请(专利权)人: 苏州道尔盾基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6872;C12Q1/6883
代理公司: 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 代理人: 韩飞
地址: 215000 江苏省苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基因突变位点 酒精代谢 检测 位点 特异性引物 乙醇脱氢酶 乙醛脱氢酶 检测试剂 试剂盒 特异性PCR扩增 单碱基延伸 实验自动化 质谱仪检测 目的片段 人员操作 实验流程 脱盐纯化 位点设计 核酸 扩增 酶切 通量 重性 消化 基因 分析
【权利要求书】:

1.一种人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括如下步骤:

(1)针对乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点和乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点设计特异性引物;

(2)利用特异性PCR扩增出包含乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点和乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点的目的片段;

(3)利用限制性内切酶消化PCR产物片段;

(4)进行单碱基延伸反应;

(5)进行脱盐纯化处理;

(6)通过核酸质谱仪检测分析目标基因乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点和乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点的序列。

2.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中设计的特异性引物包括用于扩增乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点和乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点基因的特异性引物对,所述特异性引物对包含一条乙醇脱氢酶乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点的正向引物SEQ ID Nos:1,和一条乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点的反向引物SEQ ID Nos:2,以及包含一条乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点的正向引物SEQ ID Nos:3,和一条乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点的反向引物SEQ IDNos:4。

3.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(2)中特异性PCR扩增的反应程序为:98℃热启动,10分钟;95℃变性,30秒;55℃退火,30秒;72℃延伸,30秒;扩增40个循环;72℃终延伸,5分钟。

4.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的限制性内切酶进行消化处理条件为:37℃消化处理45分钟,85℃加热变性5分钟,冰浴10分钟。

5.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的限制性内切酶为虾碱性磷酸酶。

6.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中单碱基延伸反应包括乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点和乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点的单碱基延伸引物,所述乙醇脱氢酶ADH1B基因rs1229984位点的单碱基延伸引物包含一条单碱基延伸引物SEQ ID Nos:5,所述乙醛脱氢酶ALDH2基因rs671位点的单碱基延伸引物包含一条单碱基延伸引物SEQ ID Nos:6。

7.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中单碱基延伸反应的反应程序为:95℃热启动,1分钟;95℃变性,5秒;56℃退火,5秒;80℃延伸,5秒;扩增40个循环;72℃终延伸,3分钟。

8.根据权利要求1所述的人类酒精代谢能力基因突变位点的检测方法,其特征在于,所述步骤(6)的核酸质谱检测的具体步骤为:

(1)在树脂板上铺好待用树脂,风干5-10分钟;

(2)向样本板的反应孔中加入待测的样本,补充25ul ddH2O,用封口膜密封,3000转/分钟瞬时离心;

(3)除去封口膜,将样本板倒扣在步骤(1)的树脂板上固定,然后将样本板和树脂板一起翻转,使风干的树脂落入样本板的反应孔内,用封口膜密封,3000转/分钟瞬时离心;

(4)将样本板置于旋转器上慢速旋转20分钟,再3000转/分钟离心5分钟,然后点样上机,用核酸质谱仪进行检测。

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