[发明专利]一种二阶代谢质谱多化合物检测方法、存储介质及服务器有效
申请号: | 201810678473.5 | 申请日: | 2018-06-27 |
公开(公告)号: | CN108846254B | 公开(公告)日: | 2021-08-24 |
发明(设计)人: | 殷夫;周家锐;朱泽轩;何山 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨工业大学(深圳) |
主分类号: | G16C20/80 | 分类号: | G16C20/80;G16C20/70 |
代理公司: | 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 | 代理人: | 王永文;刘文求 |
地址: | 518000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 代谢 质谱多 化合物 检测 方法 存储 介质 服务器 | ||
1.一种二阶代谢质谱多化合物检测方法,其特征在于,包括步骤:
从二阶代谢质谱数据库中获取数据库训练样本数据集S={S1,S2,…,Sn},其中,任意代谢质谱样本Sn=[(m1,i1),(m2,i2),…,(mn,in)],所述(mn,in)表示为第n条谱线的质核比与强度数值;
对所述数据库训练样本数据集S中的每个代谢质谱样本进行优化处理,获得新的样本数据集T={T1,T2,…,Tn};
以样本Tn中的每一条谱线作为可视化网络中的节点,对所述新的样本数据集T中的每一个样本Tn进行可视化操作,构建可视化网络Gn,并获得数据库可视化网络数据集G={G1,G2,......,Gn}以及相对应的搜索范围R={R1,R2,......,Rn};
根据所述搜索范围R,在输入的多化合物谱Sm上获得各自范围内的质谱数据集Sr={Sr1,Sr2,…,Srn};
根据所述质谱数据集Sr构建可视化网络,并获得所述多化合物谱上的可视化网络数据集Gm={Gm1,Gm2,......,Gmn};
对所述多化合物谱上的可视化网络数据集Gm和数据库可视化网络数据集G上各自对应的网络做最大子图同构判断,并以此作为检测模型P,通过所述检测模型P判断所述多化合物谱中是否存在与数据库中对应的化合物。
2.根据权利要求1所述的二阶代谢质谱多化合物检测方法,其特征在于,所述对所述数据库训练样本数据集S中的每个代谢质谱样本进行优化处理,获得新的样本数据集T={T1,T2,…,Tn}的步骤包括:
对所述S中每个代谢质谱样本的质谱强度进行归一化处理,将每个代谢质谱样本的质谱强度归一化到0-1000;
对每个代谢质谱样本的归一化质谱强度进行检测,当检测到代谢质谱样本中存在质谱强度小于50的谱线时,则删除所述谱线,从而获得新的代谢质谱样本Tn以及新的样本数据集T={T1,T2,…,Tn}。
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