[发明专利]沉默荣昌猪CD14表达的siRNA及筛选方法与应用在审

专利信息
申请号: 201810689608.8 申请日: 2018-06-28
公开(公告)号: CN108977444A 公开(公告)日: 2018-12-11
发明(设计)人: 焦寒伟;万堃;黄庆洲;伍莉;陈吉轩;帅学宏;赵宇;王红均 申请(专利权)人: 西南大学
主分类号: C12N15/113 分类号: C12N15/113;C12N15/10;A61K31/713;A61P39/02;A61P31/04
代理公司: 西安弘理专利事务所 61214 代理人: 许志蛟
地址: 402460 *** 国省代码: 重庆;50
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摘要:
搜索关键词: 增强型绿色荧光蛋白EGFP 猪肺泡巨噬细胞 筛选 格兰氏阴性菌 内毒素休克 内毒素血症 稳定细胞系 炎症性疾病 高效抑制 高效转染 基因治疗 融合蛋白 稳定表达 靶向 位点 转染 应用 合成 研究
【权利要求书】:

1.一种沉默荣昌猪CD14表达的siRNA,其特征在于,所述小核糖核酸分子siRNA的序列信息为:

正义,AUUGUCAGAUAGGUCCAGGGU(5′–3′);

反义,CCUGGACCUAUCUGACAAUCC(5′–3′)。

2.如权利要求1所述的一种沉默荣昌猪CD14表达的siRNA的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1,构建重组表达质粒pCD14-EGFP;

步骤2,构建稳定表达荣昌猪CD14基因的CD14-EGFP稳定细胞系;

步骤3,根据CD14基因的序列,合成针对CD14基因的四个小干扰核糖核酸分子siRNAs;

步骤4,使用高效转染试剂,将步骤3中四条siRNAs转染步骤2的CD14-EGFP稳定细胞系;

步骤5,经过步骤4的转染36h后,利用实时荧光定量聚合酶链式反应检测siRNA的抑制效果,从而筛选出其中能特异且最有效沉默荣昌猪CD14基因表达的siRNA。

3.根据权利要求2所述的一种沉默荣昌猪CD14表达的siRNA的筛选方法,其特征在于,所述步骤1具体为:

步骤1.1,根据猪CD14基因序列,同时参照pEGFP-N1载体信息,设计CD14真核表达引物F、R,并将pEGFP-N1载体多克隆位点上的Apa I和EcoR I分别作为上、下游引物的酶切位点;

其中,CD14真核表达引物F、R具体为:

F:5’-GCGCGGGCCCATGGTGAGTGTGTGCACGAGG-3’;

R:5’-CGCGGAATTCTTAGGCGAAGCCCCGGG-3’;

所述真核表达引物F、R中下划线位置处分别为pEGFP-N1载体多克隆位点上的Apa I和EcoR I的上、下游引物的酶切位点;

步骤1.2,以cDNA为模板,取步骤1.1中真核表达引物F、R进行降落PCR扩增CD14 CDS编码区,随后将扩增出的目的片段电泳,最后纯化回收扩增出的目的片段;

步骤1.3,将步骤1.1的pEGFP-N1载体与步骤1.2的目的片段同时经Apa I和EcoR I双酶切消化,经电泳回收到线性化载体与扩增产物;然后在T4DNA连接酶的介导下4℃过夜连接,将连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经IPTG蓝白斑筛选,挑取单克隆进行菌落PCR初步鉴定,将阳性重组子摇菌,提取质粒,Apa I和EcoR I双酶切鉴定,测序得到重组表达质粒pCD14-EGFP。

4.根据权利要求3所述的一种沉默荣昌猪CD14表达的siRNA的筛选方法,其特征在于,所述步骤1.2中扩增CD14CDS编码区反应总体系50μL:模板cDNA 0.5μL,上、下游引物各1μL,2×Taq PCR MasterMix 26μL,灭菌蒸馏水21.5μL;

降落PCR扩增条件为:95℃预变性2min,94℃变性20s、58℃退火20s,72℃延伸3min;依次循环以上扩增条件;当从第2个循环开始,每个循环降落1℃,直至退火温度降到50℃,再按照95℃预变性2min,94℃变性20s,50℃退火20s,72℃延伸3min进行30个循环反应;最后,72℃后延伸15min。

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