[发明专利]一组用于鉴别玉米品种的SSR分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一组用于鉴别玉米品种的SSR分子标记及其应用，共2个SSR分子标记，并提供一套适于聚丙烯酰胺凝胶电泳平台的检测所述SSR分子标记的方法。利用这2个SSR分子标记可快速地将玉米和育187及登海18进行品种区分，并实现了SSR标记与高效、高灵敏度技术的结合，节约成本，在时间上充分提高了试验效率，具有快速、操作方便、时间短、结果准确可靠等优势。本发明提供的该组引物可用于玉米指纹图谱构建、品种鉴定及遗传多样性分析等，应用前景十分广阔。

技术领域

本发明属于农作物分子生物学技术领域，具体地说，涉及一组用于鉴别玉米品种的SSR分子标记及其应用。

背景技术

玉米是我国重要的粮食作物和饲料作物，被誉为长寿食品，含有丰富的蛋白质、脂肪、维生素、微量元素等，具有开发高营养、高生物学功能食品的巨大潜力。但由于其遗传性较为复杂，变异种类丰富，因此，玉米的种子纯度及质量直接关系到农作物的产量和农民的利益。提高玉米种子纯度，规范种子市场，对提高粮食生产能力、增加农民收入等方面都有十分重要的意义。玉米的世界第三大粮食作物。玉米种子商品化程度高，市场上玉米种子品种混杂，品种繁多，易混淆。因此，研究玉米纯度、区分玉米品种的方法对商用玉米种子品种的鉴别尤为重要，有利于保障玉米育种业和种植业的健康发展。

传统的品种鉴定是根据种子、幼苗及植株的形态特征和农艺形状进行鉴定的，主要测试品种的特异性、一致性和稳定性。这些鉴定方法存在时间长、工作量大、准确度不高、占用土地等应用局限性问题，同时这种方法也只适用于品种间差异明显的样品的鉴定。利用分子技术进行品种鉴定具有不受环境影响、快速高效、可用标记多等优点。基于PCR技术的SSR技术具有多态丰富、共显性、稳定、技术简单易行、成本低等特性，目前是构建指纹图谱有效鉴别品种真实性的理想方法。

SSR简单重复序列(Simple Sequence Repeat，SSR)，也称为微卫星DNA(Microsatellite DNA)，由1-6个碱基为重复单位，形成长达数十个核苷酸的串联重复序列，如(AT)_n、(AC)_n、(GA)_n、(AAG)_n、(AAT)_n、(CATG)_n等。微卫星序列广泛分布于植物基因组中，且SSR序列在不同物种中长度、重复单位次数、突变情况有所不同，在染色体上的分布也存在差异，等位基因的多样性也由此形成。基于SSR标记技术的共显性、分布广、多态性高、低成本、高效率等优点，SSR标记已广泛应用于动植物群体分析、构建DNA指纹图谱、品种鉴定以及辅助育种等多个方面。

发明内容

本发明的目的是提供一组用于鉴别玉米品种的SSR分子标记。

为了实现本发明目的，本发明通过收集来源广泛、表型和基因型丰富、代表性强的玉米材料，对相应材料的玉米基因组进行测序并比较。本发明提供了一组用于鉴别玉米品种的玉米SSR分子标记，所述分子标记为以下2个SSR分子标记的一个或多个，分别为UMC2074，UMC1037。

所述2个SSR分子标记分别依次通过以下引物扩增得到：SEQ ID NO.1-2，SEQ IDNO.3-4。

进一步，本发明提供了用于扩增上述SSR分子标记的特异性引物对，其为以下任一对：SEQ ID NO.1-2，SEQ ID NO.3-4。

本发明提供了上述玉米SSR分子标记在构建玉米品种DNA指纹数据库中的应用。

本发明提供了上述玉米SSR分子标记在玉米种质资源遗传多样性分析中的应用。

本发明提供了上述玉米SSR分子标记在玉米鉴定中的应用。

本发明提供了上述玉米SSR分子标记在玉米分子标记辅助育种中的应用。

本发明提供了上述玉米SSR分子标记在制备玉米基因组芯片中的应用。