[发明专利]一种用于鉴定西瓜品种苏蜜6号种子纯度的RAPD引物及其应用有效
申请号: | 201810709237.5 | 申请日: | 2018-07-02 |
公开(公告)号: | CN108531643B | 公开(公告)日: | 2020-09-08 |
发明(设计)人: | 刘广;羊杏平;徐锦华;张曼;姚协丰;侯茜;任润生;朱凌丽 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 南京业腾知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32321 | 代理人: | 李静 |
地址: | 210014 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 西瓜 品种 种子 纯度 rapd 引物 及其 应用 | ||
1.一种RAPD引物在鉴定西瓜品种苏蜜6号种子纯度方面的应用,其特征在于,所述RAPD引物包括引物JAASRP1059和引物JAASCR1036,所述引物JAASRP1059的核苷酸序列为5'-GTTGCCAGCC-3';所述引物JAASCR1036的核苷酸序列为5'-GTGACGTAGG-3';所述应用方法包括如下步骤:
(1)提取西瓜品种苏蜜6号的基因组DNA;
(2)以西瓜品种苏蜜6号的基因组DNA为模板,分别利用引物JAASRP1059和JAASCR1036,进行PCR扩增,得到扩增产物;
(3)将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测;
(4)对电泳结果进行分析,以父母本样品DNA的特异标记作为对照,只有同时具有亲本特异标记的单株才可确定为苏蜜6号杂交种,否则为杂种。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,步骤(1)中,基因组DNA的提取方法为:在西瓜品种苏蜜6号两叶一心时取幼嫩叶片1.5~3.5g,经液氮研磨,用CTAB裂解液转入1.5mL离心管中,65℃水浴0.5~1h后取出冷却,加入等体积的体积比为24:1的氯仿与异戊醇的混合物,轻轻摇晃20~30min后,12000r/min离心8~10min,取上清液用体积比为24:1的氯仿与异戊醇的混合物抽提1~2次,加入10%醋酸钠和预冷的异丙醇,4℃冰箱静置3h以上,收集絮状DNA,用70%乙醇洗涤后干燥,溶于TE中,4℃保存备用。
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,步骤(2)中,PCR扩增的反应体系为18uL,其中含:20ng基因组DNA,2.0mmol·L-1 MgCl2,0.15mmol·L-1dNTPs,0.44umol·L-1 10 RAPD引物JAASRP1059或JAASCR1036,0.75U Taq DNA聚合酶。
4.如权利要求1所述的应用,其特征在于,步骤(2)中,PCR扩增的反应程序为:94℃2min,94℃30s,37℃45s,72℃90s,40个循环,72℃10min延伸。
5.如权利要求1所述的应用,其特征在于,步骤(3)中,琼脂糖凝胶电泳检测的电压为120V,电泳时间为0.5-1h。
6.如权利要求1至5任一项所述的应用,其特征在于,步骤(4)中,所述父母本样品DNA的特异标记是指:利用RAPD引物JAASRP1059扩增时,产生大小分别为350bp和450bp的母本特异标记,利用RAPD引物JAASCR1036扩增时,产生大小分别为875bp和1800bp的父本特异标记,只有同时具有亲本特异标记的单株才为真正的苏蜜6号杂交种。
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