[发明专利]一种快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法在审
申请号: | 201810736273.0 | 申请日: | 2018-07-06 |
公开(公告)号: | CN108893545A | 公开(公告)日: | 2018-11-27 |
发明(设计)人: | 陈宏;蔡翠翠;黄永震;马云;蓝贤勇;雷初朝;白跃宇 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/683 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 董芙蓉 |
地址: | 712100 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄牛 琼脂糖凝胶电泳 快速检测 黄牛全基因组DNA 标记辅助选择 分子遗传标记 限制性内切酶 生产性状 生长性状 基因 可用 扩增 酶切 上筛 牛肉 消化 检测 | ||
1.一种快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,其特征在于,包括以下步骤:
以黄牛血液全基因组DNA为模板,在2×Taq PCR MasterMix存在的情况下,利用1对PCR引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶对其进行酶切,再通过电泳检测即能鉴定黄牛ACTL8基因外显子区SNP。
2.根据权利要求1所述的快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,其特征在于,所述的PCR扩增1对PCR引物包括:
上游引物Forward primer:5'-CCTGGCTCTTCCTGATCCTC-3'和下游引物Reverseprimer:5'-TCCTCCTTCGTCAGCCACTC-3';
所述的PCR扩增的条件是:12.5μL反应体系包括2×Taq PCR MasterMix 6.25μL,ddH2O4.75μL,100ng黄牛基因组血液DNA,10pmol/μL上、下游引物各0.5μL;
PCR反应程序为:95℃预变性5min;然后94℃变性30s,62.5℃复性60s,72℃延伸30s,如此进行32个循环;最后,72℃延伸10min,4℃保存。
3.根据权利要求2所述的快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,其特征在于,所述的SNP位点为黄牛ACTL8基因第十外显子第138位核苷酸存在G/A碱基的多态性。
4.根据权利要求3所述的快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,其特征在于,所述的限制性内切酶为MaeI;10μL MaeI酶切体系包括:1μL含BSA的10×缓冲液,0.2μL的浓度为10U/μL的MaeI限制性内切酶,5μL权利要求2中的PCR产物,3.8μL的灭菌超纯水;
酶切消化条件:37℃恒温箱中消化8~12h。
5.根据权利要求4所述的快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,其特征在于,所述的电泳检测是用1.0%~3.0%琼脂糖凝胶电泳分析限制性内切酶MaeI消化PCR扩增片段,G碱基突变表现为:588bp和297bp,A突变表现为:885bp,相应地,GG型表现:588bp和297bp;GA型表现:885bp,588bp,297bp;AA型表现:885bp。
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