[发明专利]用于定量检测EB病毒核酸的数字PCR试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201810737842.3 | 申请日: | 2018-07-06 |
公开(公告)号: | CN110684863A | 公开(公告)日: | 2020-01-14 |
发明(设计)人: | 严晓锋;刘凤麟;熊慧 | 申请(专利权)人: | 苏州云泰生物医药科技有限公司;武汉百泰基因工程有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 11390 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 胡剑辉 |
地址: | 215130 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 数字PCR 探针 试剂盒 核酸 病毒核酸检测 检测EB病毒 定量检测 发明试剂 反向引物 核酸分子 两端标记 效率差异 荧光基团 正向引物 灵敏性 质控品 检测 引物 标准化 | ||
本发明属于病毒核酸检测领域,具体涉及一种用于定量检测EB病毒核酸的数字PCR试剂盒及检测方法。本发明试剂盒含有数字PCR反应液和质控品;数字PCR反应液中含有用于检测EB病毒核酸的引物和探针,包括由SEQ ID NO:1所示的正向引物、由SEQ ID NO:2所示的反向引物、由SEQ ID NO:3所示的探针;探针的两端标记有荧光基团。本发明的试剂盒及检测方法可实现对核酸分子的绝对定量,从而避免了由PCR扩增效率差异所导致的偏差,具有更高的精确度、灵敏性和重复性,易于标准化。
技术领域
本发明属于病毒核酸检测领域,具体涉及一种用于定量检测EB病毒核酸的数字PCR试剂盒及检测方法。
背景技术
人类是EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)惟一天然宿主,EB病毒的全世界人感染率超过90%。原发感染通常发生在幼年时期,并且无症状,表现为隐性感染;但如果感染发生在青少年或成年,则可能导致感染性单核细胞增多症。据报道,我国95%以上人群在3~5岁时已感染了EBV。原发感染后,病毒可以长期持续性存在,呈潜伏感染状态,在大多数病例中无症状。EB病毒主要经唾液传播,但也有报道经血液和性活动传播。EB病毒感染细胞有两种形式:即潜伏性感染和增殖性感染。在潜伏性感染中,病毒以环状游离体和/或整合型形式存在。在一定条件下,如免疫功能低下或某些物理化学因素的作用(紫外线、丁酸、巴豆油及尿嘧啶等),EB病毒可以从潜伏状态变为增殖状态。
我国是鼻咽癌的高发国家,其发病率占头颈部肿瘤的首位。已有大量的实验研究表明,EB病毒与鼻咽癌关联密切,放疗前血浆EBVDNA检测对NPC的临床分期和判断预后有重要的临床意义,放疗结束时血浆EBV DNA检测对残留病灶和总生存判断同样具有重要意义,并对放疗后肿瘤转移复发有监测作用。传统的EB病毒相关抗体的检测是诊断及监测患者病情最常用的方法,但是它的敏感性和特异性较差。目前的荧光定量PCR对原有核酸只能进行相对定量,需要依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,且对病毒是否为阳性的检测存在不确定的检测结果,导致多次检测,或者检测结果不准确。ddPCR技术的引入为直接和真实地反映患者体内病毒复制水平,为我们在肿瘤的诊断、治疗和判断预后方面提供了一种新的非侵入性手段。
数字PCR技术是近年兴起的第三代PCR绝对定量技术,与实时荧光定量PCR技术相比,数字PCR不依赖于扩增曲线的阈值(CT)进行定量,不受扩增效率的影响,也不必采用标准曲线,具有很好的准确度和重现性,可以实现绝对定量分析。在现阶段的低丰度因子检测中,实时荧光定量PCR技术都因受到背景DNA或杂质的干扰,使得检测灵敏度及精确性都达不到精准定量的要求,而数字PCR检测系统通过微滴化处理,使得稀有检测片段从大量的复杂背景中分离出来,从而提高检测的灵敏度和精确性。
鉴于此,特提出本发明。
发明内容
本发明的发明目的在于提出一种用于定量检测EB病毒核酸的数字PCR试剂盒及检测方法。
本发明的又一发明目的在于提出一种采用数字PCR检测EB病毒核酸的引物和探针。
为了完成本发明的目的,采用的技术方案为:
本发明涉及一种用于定量检测EB病毒核酸的数字PCR试剂盒,所述试剂盒含有数字PCR反应液和质控品;所述数字PCR反应液中含有用于检测EB病毒核酸的引物和探针,所述用于检测EB病毒核酸的引物和探针包括由SEQ ID NO:1所示的正向引物、由SEQ ID NO:2所示的反向引物、由SEQ ID NO:3所示的探针;所述探针的两端标记有荧光基团。
可选的,SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的5’端标记有FAM、3’端标记有BHQ。
可选的,所述数字PCR反应液中还含有数字PCR缓冲液。
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