[发明专利]一种快速测定乳粉中致病菌的方法在审
申请号: | 201810778691.6 | 申请日: | 2018-07-16 |
公开(公告)号: | CN108841977A | 公开(公告)日: | 2018-11-20 |
发明(设计)人: | 吴冰;蔡先全;郑传发;邱霞;张任广;吉宇恒 | 申请(专利权)人: | 中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/04;C12R1/42;C12R1/01;C12R1/445 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 罗毅萍 |
地址: | 528400 广东省中*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳粉 寡核苷酸引物 致病菌 沙门氏菌 金黄色葡萄球菌 检测 核酸模板 快速测定 志贺氏菌 荧光定量PCR检测 荧光定量PCR试剂 合成 分析检测数据 保守基因 定量测定 检测分析 煮沸 靶基因 灵敏度 重现性 准确率 小管 查询 | ||
1.一种快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、乳粉中核酸模板的提取:
取25g待检乳粉加入营养肉汤中36℃培养24小时,取1mL培养液,加入到1.5mL无菌离心管中,6000-8000r/min离心5-10min,吸弃上清,加入50μLDNA提取液,混匀后沸水浴5-10min,10000-12000r/min离心5-10min,取上清液作为核酸模板;
S2、寡核苷酸引物的合成:
查询沙门氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌的特异保守基因,以此为靶基因设计、合成寡核苷酸引物;
S3、荧光定量PCR检测:
将步骤S1所得核酸模板分别加入装有步骤S2所得不同特异寡核苷酸引物对的小管中,再加入相应的荧光定量PCR试剂,在同一轮荧光定量PCR循环下,对乳粉中的沙门氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌进行定量检测;
S4、检测分析:分析检测数据。
2.根据权利要求1所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:在步骤S1中,取25g待检乳粉加入营养肉汤中36℃培养24小时,取1mL培养液,加入到1.5mL无菌离心管中,8000r/min离心5min,吸弃上清,加入50μLDNA提取液,混匀后沸水浴5min,12000r/min离心5min,取上清液作为核酸模板。
3.根据权利要求1所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于,步骤S2包括以下步骤:
1)登录GenBank,在核酸数据库中检索所述沙门氏菌、所述志贺氏菌、所述金黄色葡萄球菌的目的基因序列,逐个核对后筛选出测序质量较好的基因序列;
2)应用Primer Premier 5.0软件对步骤1)所得基因序列进行特异寡核苷酸引物设计;
3)将步骤2)所设计的候选序列递交到GenBank进行BLAST比较,筛选出特异性较好的序列进行寡核苷酸引物的合成。
4.根据权利要求1所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:所述寡核苷酸引物的长度为18-28bp,碱基成分中G+C含量为40%-60%,所有所述寡核苷酸引物的退火温度Tm值为60-70℃。
5.根据权利要求1所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:所述沙门氏菌、所述志贺氏菌、所述金黄色葡萄球菌的所述寡核苷酸引物的退火温度差为0-5℃。
6.根据权利要求3所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:步骤1)检索到所述沙门氏菌的目的基因fimA序列,经过步骤2)设计及步骤3)的筛选后,合成所述寡核苷酸引物Sal-fim-1(5’–TACCAACCGGCAAGGCATAA-3’)和Sal-fim-2(5’-GACACCGCCGTTTAAGAAATG-3’)。
7.根据权利要求3所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:步骤1)检索到所述志贺氏菌的目的基因ipaH序列,经过步骤2)设计及步骤3)的筛选后,合成所述寡核苷酸引物Sf-ipa-1(5’–CCGGGATAAAGTCAGAACTC-3’)和Sf-ipa-2(5’-CTCCCGACACGCCATAGAAA-3’)。
8.根据权利要求3所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:步骤1)检索到所述金黄色葡萄球菌的目的基因16s RNA序列,经过步骤2)设计及步骤3)的筛选后,合成所述寡核苷酸引物Sa-16s-1(5’–CCTTATGACCTGGGCTACAC-3’)和Sa-16s-2(5’-AACGGTTTTATGAGATTAGCTCC-3’)。
9.根据权利要求1所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:步骤S3所述荧光定量PCR的条件为:预变性温度为95℃、时间为30S,变性温度为95℃、时间为10S,退火温度为62℃、时间为1min,循环数为40。
10.根据权利要求1所述的快速测定乳粉中致病菌的方法,其特征在于:步骤S3所述荧光定量PCR试剂为SYBR荧光染料。
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