[发明专利]一种检测稻曲病病菌的方法在审
申请号: | 201810793250.3 | 申请日: | 2018-07-19 |
公开(公告)号: | CN108893530A | 公开(公告)日: | 2018-11-27 |
发明(设计)人: | 乔保建;夏祥华;任代胜;付锡江;陶元平;彭冲;宾娜 | 申请(专利权)人: | 安徽袁粮水稻产业有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6895 |
代理公司: | 芜湖思诚知识产权代理有限公司 34138 | 代理人: | 杨涛 |
地址: | 241000 安徽省芜湖市弋*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 稻曲病 病菌 种检测 病原菌 分子生物学领域 基因组DNA序列 特异性引物 快速鉴定 直接提取 样本DNA 筛选 转化 | ||
1.一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于,包含以下操作步骤:
(1)将已知的稻曲病菌株活化培养后收集菌丝球,滤纸吸干菌丝外表水分,放入-20℃冰箱储存备用;
(2)菌丝冷冻干燥后采取CTAB法提取DNA,检测提取DNA的浓度和纯度,之后将检测的DNA样品放入-20℃冰箱保存备用;
(3)采用随机引物对供试菌株DNA进行PCR扩增,产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,80V电泳45min后切胶回收DNA;
(4)将回收的稻曲病菌特异性随机引物扩增片段与pGEM-T载体连接后转入大肠杆菌DH-5α中;
(5)采用菌落PCR筛选阳性单克隆,单克隆摇菌培养后提取质粒,对插入片段测序;
(6)将测序后的序列输入NCBI核酸数据库作BLAST分析,与GeneBank中己有序列进行同源性对比,验证序列为稻曲病菌的特异性序列,采用Primer 5.0设计病菌分子检测的特异性SCAR引物;
(7)在稻曲病发生的田块,于水稻黄熟期,采集病穗的谷粒,70%乙醇浸泡1min,无菌条件下分别剥取病穗谷粒颖壳和健穗谷粒颖壳各1g,CTAB法提取DNA,将提取的DNA测定浓度并稀释后作为DNA模板;
(8)采用SCAR引物对待测稻曲病菌DNA进行扩增,产物进行1.6%琼脂糖凝胶电泳,恒压80V电泳45min,紫外下在400bp处出现条带即为稻曲病菌鉴定阳性。
2.根据权利要求1中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于:所述随机引物为随机10聚体寡聚核苷酸,选用对稻曲病菌DNA能够扩增出稳定多态性条带的随机引物。
3.根据权利要求1中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于,所述随机引物扩增的体系为:引物1μL、DNA模板2μL、5×Taq MasterMix 5μL、ddH2O 17μL。
4.根据权利要求1中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于,所述随机引物扩增的反应条件为:95℃,5min;95℃,30s;51℃,45s;72℃,45s,35循环;72℃,7min,4℃保存。
5.根据权利要求1中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于,所述稻曲病菌株活化培养方法为:在马铃薯琼脂蔗糖培养基上培养10d后,沿菌落边缘切取菌丝3块转接到装有100mL的马铃薯蔗糖液体培养基的三角瓶内,于28℃,160rpm摇床上振荡培养8~9d,直接用纱布过滤,无菌水冲洗2~3次,收集菌丝球。
6.根据权利要求1中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于,所述SCAR引物对待测稻曲病菌进行扩增鉴定的体系为:1μL上游引物,1μL下游引物,1μL DNA模板,5μL DreamTaqGreen PCR Master Mix(5X)和17μL双蒸水。
7.根据权利要求1中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于,所述SCAR引物对待测稻曲病菌进行扩增鉴定的反应条件为:95℃,5min;95℃,40s;53℃,50s;72℃,45s,35循环;72℃,10min,4℃保存。
8.根据权利要求3或7中的一种检测稻曲病病菌的方法,其特征在于:DNA模板的浓度为200ng/μL。
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