[发明专利]基于计算云平台的微生物多样性交互分析系统及其方法在审
申请号: | 201810797363.0 | 申请日: | 2018-07-19 |
公开(公告)号: | CN109192242A | 公开(公告)日: | 2019-01-11 |
发明(设计)人: | 余果;任一;郭权;王兆月;董亚晨;刘林梦;赵建华;杨慧;宣红东 | 申请(专利权)人: | 上海桑格信息技术有限公司 |
主分类号: | G16B10/00 | 分类号: | G16B10/00;G16B45/00 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 许亦琳;余明伟 |
地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 微生物多样性 基础分析 交互分析 云平台 结果分析模块 任务提交模块 数据分析平台 项目管理模块 高集成化 高级分析 基础参数 项目文件 项目信息 用户请求 预设格式 原始数据 可视化 云计算 整合 封装 个性化 分析 涵盖 展示 管理 | ||
1.一种基于计算云平台的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,包括:
项目管理模块,用于对项目信息进行查看和管理;
基础分析任务提交模块,用于设置基础参数运行任务,并将结果以及原始数据按照预设格式整合封装成相应的项目文件;
交互式结果分析模块,用于根据用户请求生成分析结果,并将结果可视化展示;
所述项目管理模块通过基础分析任务提交模块与交互式结果分析模块相连接。
2.如权利要求1所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述项目管理模块与交互式结果分析模块相连。
3.如权利要求1所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述基础分析任务模块用于设置基础分析任务的参数,调取数据分析工具运行基础分析任务进而基于原始数据获得基础分析任务分析结果,将基础分析任务分析结果与原始数据整合生成项目文件。
4.如权利要求1所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述基础分析任务提交模块还用于数据质控。
5.如权利要求1所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述项目文件包括中间过程文件数据。
6.如权利要求1所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述基础分析任务提交模块预设基础分析任务,所述基础分析任务至少包括:OTU聚类、物种分类、Alpha多样性和Beta多样性分析任务。
7.如权利要求6所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述基础分析任务还包括数据质控统计。
8.如权利要求1所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,交互式结果分析模块至少可用于:
1)从基础分析任务提交模块形成的项目文件中获取分析结果数据,并以分析结果数据作为输入数据,根据用户请求进行交互分析获得交互分析文本;
2)将基础分析任务提交模块形成的分析结果文本或交互分析文本根据用户请求可视化展示。
9.如权利要求8所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述交互式结果分析模块预设有以下一种或多种交互分析任务:物种注释与评估、物种差异分析、高级生物信息学分析和个性化生物信息学分析。
10.如权利要求8所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,交互式结果分析模块还可用于:
3)根据用户请求,对基础分析任务提交模块形成的分析结果数据进行再计算获得调整的分析结果数据。
11.如权利要求10所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述交互式结果分析模块预设有基础分析任务中的一种或多种分析任务。
12.如权利要求10所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述再计算以基础分析任务提交模块形成的分析结果数据或中间过程文件数据作为输入数据,基于用户在交互式结果分析模块设置的参数及分析任务请求,对已有的分析结果再计算,从而获得经调整的分析结果数据。
13.如权利要求1-12任一权利要求所述的微生物多样性交互分析系统,其特征在于,所述交互式结果分析模块还包括图表工具。
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