[发明专利]乳腺癌分型基因群及其应用

说明书

本发明提供一组乳腺癌分型基因群，可将乳腺癌分为间质型、增殖型和代谢型三种亚型，不同亚型的乳腺癌具有不同的基因表达谱。不同亚型的乳腺癌病人对内分泌治疗药物和化疗药物有不同的反应，据此采用合适的药物将极大的提高乳腺癌病人的生存率。本发明对乳腺癌分型基因群可用于制备乳腺癌分型检测试剂盒，对乳腺癌进行分型，适用于临床指导用药，对于实现乳腺癌的精准治疗具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一组乳腺癌分型基因群及其应用。

背景技术

高通量的癌症基因组学证实，乳腺癌并非单一疾病，而是由多种亚型组成的疾病。目前通过基因表达谱对乳腺癌几个亚型(PAM50,专利号WO2009158143 A1)：管腔A型、管腔B型、HER2阳性型、基底细胞型，以及类正常细胞型。这种对癌症进行分型对预后有比较准确的预测效果。比如，管腔A型，侵袭性与转移性比较弱，术后复发转移风险相对低，对内分泌治疗比较敏感。管腔B型预后中等，需要内分泌治疗联合化疗。HER2阳性型和基底细胞型则预后很差。HER2阳性型，一般用抗HER2靶向治疗(曲妥珠单抗)联合化疗和(或)内分泌治疗。基底细胞型预后最差，需要化疗治疗。

另外一种技术(Oncotype Dx)是对专门针对雌激素受体阳性及淋巴结阴性的乳腺癌病人，用21个基因表达量来计算复发分数，复发分数低的病人只需要内分泌治疗，复发分数高的病人则需要化疗。

然而，以上两种基因分型技术均存在一些问题。PAM50分子分型不够精准，比如是否存在类正常细胞型还存在争论，各亚型之间的比例也不确定。另外，PAM50无法精确地证实哪种亚型需要用具体的化疗药物。Oncotype Dx只是针对雌激素受体阳性的乳腺癌病人，而不适用于雌激素受体阴性的病人。

发明内容

针对上述技术问题，本发明提供了乳腺癌分型基因群，其将乳腺癌病人的肿瘤分成三种亚型：间质型、增殖型和代谢型。不同亚型的乳腺癌病人对内分泌治疗药物和化疗药物有不同的反应，根据这三种类型采用合适的药物将极大的提高乳腺癌病人的生存率，尽量避免不适用药物，这样会减小化疗的毒性和副作用。

本发明的一方面提供一组乳腺癌分型基因群，所述基因群包含间质型乳腺癌基因指纹谱、增殖型乳腺癌基因指纹谱和代谢型乳腺癌基因指纹谱，所述间质型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号1-20所示的基因，所述增殖型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号21-40所示的基因，所述代谢型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号41-60所示的基因。

进一步地，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌。

进一步地，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌。

进一步地，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。

本发明的另一方面提供上述乳腺癌分型基因群在制备乳腺癌分型检测试剂盒中的应用，其中，所述检测试剂盒包括扩增所述乳腺癌分型基因群的基因的引物。

本发明的另一方面还提供了所述乳腺癌分型基因群在乳腺癌分型中的应用，所述基因群将乳腺癌分为间质型乳腺癌、增殖型乳腺癌和代谢型乳腺癌三种亚型，其中，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。

本发明还提供了乳腺癌分型基因群在乳腺癌指导用药中的应用，所述基因群将乳腺癌分为间质型乳腺癌、增殖型乳腺癌和代谢型乳腺癌三种亚型，其中，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。

进一步地，他莫昔芬适用于所述间质型乳腺癌的治疗。

进一步地，紫杉醇适用于所述增殖型乳腺癌的治疗。