[发明专利]一种基于化学反应简化的O-GalNAc糖基化肽段鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201810818587.5 申请日: 2018-07-24
公开(公告)号: CN110749736A 公开(公告)日: 2020-02-04
发明(设计)人: 叶明亮;由昕;秦洪强 申请(专利权)人: 中国科学院大连化学物理研究所
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;G01N30/02
代理公司: 21002 沈阳科苑专利商标代理有限公司 代理人: 马驰
地址: 116023 辽宁*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 糖基化 水解 末端唾液酸残基 唾液酸酶活性 化学反应 检测灵敏度 结构复杂性 糖基化结构 糖基化肽段 唾液酸残基 碎裂 加热条件 酸性基质 规模化 唾液酸 有机酸 去除 糖肽 质谱 商品化 分析
【权利要求书】:

1.一种基于化学反应简化的O-GalNAc糖基化肽段鉴定方法,其特征在于:

并利用有机酸去除O-GalNAc糖肽中的唾液酸,然后进行质谱检测,最后通过数据库检索进行O-GalNAc糖肽的分析。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:是一种酸辅助糖型简化的O糖基化肽段鉴定方法,首先对复杂的O-GalNAc糖肽进行富集,并利用有机酸去除富集的O-GalNAc糖肽中的唾液酸,有效降低糖肽结构的复杂程度,并提高糖肽在质谱中的检测灵敏度和碎裂效率,最后通过数据库直接检索进行O-GalNAc糖肽的分析。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:

利用有机酸去除富集的O-GalNAc糖肽中的唾液酸是:利用化学反应释放糖肽末端的唾液酸结构,有效降低糖链结构的复杂程度,简化O-GalNAc糖基化肽段的结构和异质性,提高糖肽的检测灵敏度。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:

质谱检测过程为:针对去唾液酸化的简化O-GalNAc糖肽结构进行质谱碎裂,唾液酸的去除有助于提高O-GalNAc糖肽的离子化效率,并降低糖肽二级谱中性丢失的概率,提高肽段骨架序列的碎裂效率;

针对去唾液酸化O-GalNAc糖肽结构简化的谱图,其候选检索糖型结构数目减少,显著降低检索空间和随机匹配的错误率,提高O-GalNAc糖肽的鉴定效率。

5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:

利用有机酸去除O-GalNAc糖肽中的唾液酸是:基于唾液酸糖苷键在酸性条件不稳定的特性,发展基于有机酸-加热条件水解其糖苷键,实现O-GalNAc末端唾液酸的高效释放,进而实现酸辅助的糖型简化策略。

6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:

O-GalNAc糖肽结构碎裂:去唾液酸化的简化O-GalNAc糖肽结构进行质谱碎裂,针对糖肽易发生中性丢失,肽段骨架序列碎裂效率低的问题,发展基于高-低能量结合的模式,实现O-GalNAc糖肽的肽段骨架和糖链结构的同时碎裂。

7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:

O-GalNAc糖肽数据检测去:唾液酸化O-GalNAc糖肽结构简化的谱图,其候选检索糖型结构数目减少,其搜库检索空间和随机匹配的错误率显著降低,发展O-GalNAc直接搜库检索策略,其可变修饰包O糖基化修饰包括丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)上分别增加+365.1322Da(Gal-GalNAc)或+203.0875Da(GalNAc)或+730.2644Da(Gal-(Gal-GlcNAc-)GalNAc)等,并设定相应的中性丢失,提高O-GalNAc糖肽的鉴定效率。

8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:有机酸-加热条件水解中的有机酸为三氟乙酸,其于反应体系中的体积分数为1%(v/v);加热反应的温度为75℃,反应时间为60分钟。

9.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:所述O-GalNAc糖肽是于人血清样品中富集的O-GalNAc糖肽。

10.根据权利要求1-9任一所述的方法,其特征在于:

该策略的研究对象是组织或/细胞中内源性的O-GalNAc糖基化分析,其采用的化学反应试剂均为常用试剂,反应条件温和,副反应效率低,能够显著降低O-GalNAc糖基化的糖型复杂程度,并提高糖肽的检测灵敏度,可用于多种生物样本的O连接糖基化蛋白质组分析。

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