[发明专利]一种基于化学反应简化的O-GalNAc糖基化肽段鉴定方法在审
申请号: | 201810818587.5 | 申请日: | 2018-07-24 |
公开(公告)号: | CN110749736A | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 叶明亮;由昕;秦洪强 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大连化学物理研究所 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N30/02 |
代理公司: | 21002 沈阳科苑专利商标代理有限公司 | 代理人: | 马驰 |
地址: | 116023 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 糖基化 水解 末端唾液酸残基 唾液酸酶活性 化学反应 检测灵敏度 结构复杂性 糖基化结构 糖基化肽段 唾液酸残基 碎裂 加热条件 酸性基质 规模化 唾液酸 有机酸 去除 糖肽 质谱 商品化 分析 | ||
1.一种基于化学反应简化的O-GalNAc糖基化肽段鉴定方法,其特征在于:
并利用有机酸去除O-GalNAc糖肽中的唾液酸,然后进行质谱检测,最后通过数据库检索进行O-GalNAc糖肽的分析。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:是一种酸辅助糖型简化的O糖基化肽段鉴定方法,首先对复杂的O-GalNAc糖肽进行富集,并利用有机酸去除富集的O-GalNAc糖肽中的唾液酸,有效降低糖肽结构的复杂程度,并提高糖肽在质谱中的检测灵敏度和碎裂效率,最后通过数据库直接检索进行O-GalNAc糖肽的分析。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:
利用有机酸去除富集的O-GalNAc糖肽中的唾液酸是:利用化学反应释放糖肽末端的唾液酸结构,有效降低糖链结构的复杂程度,简化O-GalNAc糖基化肽段的结构和异质性,提高糖肽的检测灵敏度。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:
质谱检测过程为:针对去唾液酸化的简化O-GalNAc糖肽结构进行质谱碎裂,唾液酸的去除有助于提高O-GalNAc糖肽的离子化效率,并降低糖肽二级谱中性丢失的概率,提高肽段骨架序列的碎裂效率;
针对去唾液酸化O-GalNAc糖肽结构简化的谱图,其候选检索糖型结构数目减少,显著降低检索空间和随机匹配的错误率,提高O-GalNAc糖肽的鉴定效率。
5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:
利用有机酸去除O-GalNAc糖肽中的唾液酸是:基于唾液酸糖苷键在酸性条件不稳定的特性,发展基于有机酸-加热条件水解其糖苷键,实现O-GalNAc末端唾液酸的高效释放,进而实现酸辅助的糖型简化策略。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:
O-GalNAc糖肽结构碎裂:去唾液酸化的简化O-GalNAc糖肽结构进行质谱碎裂,针对糖肽易发生中性丢失,肽段骨架序列碎裂效率低的问题,发展基于高-低能量结合的模式,实现O-GalNAc糖肽的肽段骨架和糖链结构的同时碎裂。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:
O-GalNAc糖肽数据检测去:唾液酸化O-GalNAc糖肽结构简化的谱图,其候选检索糖型结构数目减少,其搜库检索空间和随机匹配的错误率显著降低,发展O-GalNAc直接搜库检索策略,其可变修饰包O糖基化修饰包括丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)上分别增加+365.1322Da(Gal-GalNAc)或+203.0875Da(GalNAc)或+730.2644Da(Gal-(Gal-GlcNAc-)GalNAc)等,并设定相应的中性丢失,提高O-GalNAc糖肽的鉴定效率。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:有机酸-加热条件水解中的有机酸为三氟乙酸,其于反应体系中的体积分数为1%(v/v);加热反应的温度为75℃,反应时间为60分钟。
9.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:所述O-GalNAc糖肽是于人血清样品中富集的O-GalNAc糖肽。
10.根据权利要求1-9任一所述的方法,其特征在于:
该策略的研究对象是组织或/细胞中内源性的O-GalNAc糖基化分析,其采用的化学反应试剂均为常用试剂,反应条件温和,副反应效率低,能够显著降低O-GalNAc糖基化的糖型复杂程度,并提高糖肽的检测灵敏度,可用于多种生物样本的O连接糖基化蛋白质组分析。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国科学院大连化学物理研究所,未经中国科学院大连化学物理研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201810818587.5/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种示踪剂
- 下一篇:一种定量检测牛奶中雌二醇的量子点免疫层析试纸