[发明专利]一种鉴定西瓜炭疽病抗性的SSR引物及方法有效

专利信息
申请号: 201810826669.4 申请日: 2018-07-25
公开(公告)号: CN110760602B 公开(公告)日: 2022-12-27
发明(设计)人: 程维舜;张安华;曾丹黎;王萍;祝菊红;李煜华;蔡翔;阳永学;赵志远 申请(专利权)人: 武汉市农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 武汉智权专利代理事务所(特殊普通合伙) 42225 代理人: 张凯
地址: 430000 湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 鉴定 西瓜 炭疽病 抗性 ssr 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种鉴定西瓜炭疽病抗性的SSR引物,其特征在于:所述SSR引物,其正向引物为5’-AGAGGAATGTGGTAATGAATAAACATCT-3’,其核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO.1所示;其反向引物为5’-AATTGGCCCAAATATCCATATGAC-3’,其核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO.2所示。

2.一种采用如权利要求1所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的SSR引物鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:

提取待测西瓜样品的DNA;

使用荧光标记的SSR引物对提取出的待测西瓜样品的DNA进行PCR扩增;

对PCR扩增产物进行毛细管电泳荧光检测,根据检测结果判断西瓜是否具有炭疽病抗性。

3.如权利要求2所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:所述提取待测西瓜样品的DNA,具体包括以下步骤:

将待测西瓜样品置于离心管中,加入液氮,用组织捣碎仪打碎待测样品;

向离心管中加入十六烷基三甲基溴化铵CTAB预热缓冲液,水浴,再加入氯仿-异戊醇,混匀离心;

吸取上清液加入装有异丙醇的离心管中,混匀离心;

弃上清液,用70%乙醇溶液洗涤沉淀,干燥后加入双蒸水。

4.如权利要求3所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:用组织捣碎仪打碎待测样品之前,在待测样品上撒上二乙基二硫代氨基甲酸DIECA晶体。

5.如权利要求3所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:水浴前,向离心管中加入活性炭。

6.如权利要求2所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:所述使用SSR引物对提取出的待测西瓜样品的DNA进行PCR扩增,包括以下步骤:

在PCR管中加入脱氧核糖核苷三磷酸、荧光标记的正向引物和反向引物、TaqDNA聚合酶、含Mg2+的PCR缓冲液,待测西瓜样品的DNA和双蒸水,混匀后置于PCR仪上进行PCR扩增。

7.如权利要求6所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应流程包括:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸40s,共34个循环;72℃延伸10min,4℃保存待用。

8.如权利要求2所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:所述对PCR扩增产物进行毛细管电泳荧光检测,根据毛细管电泳荧光检测结果判断西瓜是否具有炭疽病抗性,具体包括以下步骤:

将6-FAM荧光标记、HEX荧光标记的PCR扩增产物分别用超纯水稀释30倍,将TAMRA荧光标记、ROX荧光标记的PCR扩增产物分别用超纯水稀释10倍;

分别取等体积的上述4种PCR扩增产物稀释后的溶液混合制得混合液,将混合液加入DNA分析仪专用深孔板中,向DNA分析仪专用深孔板中各孔分别加入LIZ500分子量内标和去离子甲酰胺;

在PCR分析仪上95℃变性,取出冷却,瞬时离心后置放到DNA分析仪上进行毛细管电泳检测;

使用DNA分析仪的片段分析软件进行图像分析,并将毛细管电泳数据制成电泳检测图谱;根据电泳检测图谱判断西瓜是否具有炭疽病抗性。

9.如权利要求2所述的鉴定西瓜炭疽病抗性的方法,其特征在于:所述待测西瓜样品包括抗病亲本与感病亲本,以及两者杂交后代。

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