[发明专利]与绵羊多羔相关的SNP分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 201810847318.1 申请日: 2018-07-27
公开(公告)号: CN108866206B 公开(公告)日: 2021-07-27
发明(设计)人: 储明星;胡文萍;梁奔梦;董新龙;刘秋月;狄冉;王翔宇;汤继顺;郭晓飞;魏彩虹 申请(专利权)人: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君;陈征
地址: 100193 北京市海淀区圆明园西路*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 绵羊 相关 snp 分子 标记 及其 应用
【说明书】:

发明提供与绵羊产羔相关的SNP分子标记及其应用,该分子标记位于绵羊第12号染色体第55865867位(NW_014639021.1),是Pappa2基因SNP标记。本发明提供了用于检测该SNP标记的特异性引物组合,特异性引物组合的序列如SEQ ID NO.1‑3所示,基于SequenomSNP技术可实现对所述SNP分子标记的检测,并根据检测结果判定绵羊Pappa2基因为纯合或杂合。本发明为绵羊育种提供辅助方法,通过对绵羊Pappa2基因型进行选择,可以将具有高产羔数性状的CG杂合个体和CC纯合个体选留下来,从而提高绵羊的繁殖力,对绵羊大规模分子育种具有潜在的应用价值。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及与绵羊多羔性状相关的SNP分子标记、以及检测绵羊多羔性状的方法。

背景技术

产羔数性状是绵羊最重要的经济性状之一,因其受微效多基因控制且遗传力低,难以用常规育种方法来快速改良,而分子技术能有效快速地提高其遗传进展,因此鉴定与产羔数相关的主效基因或分子遗传标记是现代分子育种的关键。

2001年,Michael T.Overgaard等在JBC发表文章称,他们在哺乳动物细胞中表达了重组的PAPP-A2蛋白,发现重组的PAPP-A2蛋白的1558个氨基酸残基的多肽是由1791个氨基酸残基的前蛋白原(prepro-protein)加工而来的。和PAPP-A不同,PAPP-A2在非还原的SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳中是以一个大概220kDa的单体迁移。PAPP-A2的前体和PAPP-A是不同源的,但是成熟的PAPP-A2和PAPP-A有45%的氨基酸残基相同。PAPP-A可以特异性地剪切胰岛素样生长因子结合蛋白4(Insulin-like Growth Factor-binding Protein-4,IGFBP-4)。IGFBP-4是6个已知的胰岛素生长因子IGF-I和IGF-II的调节因子之一。Overgaard等的研究发现PAPP-A2可以特异性地剪切胰岛素样生长因子结合蛋白5(Insulin-like GrowthFactor-binding Protein-5,IGFBP-5)在Ser-142和Lys-144之间的一个位点,从而使得IGFI和IGFII产生活性,该基因和生长以及繁殖相关性状有紧密联系。PAPP-A2很有可能是IGFBP-5在很多组织中的候选蛋白酶。

2014年,研究发现,Pappa2基因通过IGFBP-5信号通路发挥功能,2015年,Christians J K等人在小鼠中发现pappa2基因敲除后,IGFBP-5在卵巢中的表达量显著增加,同时有研究指出在小鼠中IGFBP-5和卵泡发育密切相关。

2004年,Conover et al.研究发现Pappa2基因敲除小鼠的体型大小是野生型小鼠的60%。2010年,Nyegaard et al等人揭示了Pappa2基因敲除小鼠的卵巢功能和繁殖力都有所下降。

2011年,Cheryl A.Conover获得了Pappa2基因双敲除的小鼠,检测了在野生型小鼠中PAPP-A2的mRNA的组织特异性表达,且鉴定了缺失PAPP-A2的小鼠的表型。PAPP-A2在组织中的表达和PAPP-A并不相关。研究发现在胎盘中有最高水平的PAPP-A2的表达,在胚胎、骨骼肌、繁殖相关组织中也有高水平的PAPP-A2的表达。纯合的Pappa2基因敲除小鼠在出生时大小正常。但是,出生后的生长速度却比正常小鼠更迟缓。雄性的双敲小鼠的体重较正常小鼠降低了10%,雌性双敲小鼠体重降低了25-30%。双敲的成年小鼠的股骨长和体长也变短了。Pappa2的敲除会影响动物幼崽的体重和骨骼发育情况。并且研究发现和野生型相比,Pappa2基因敲除的小鼠虽然也可以繁殖,但是产仔数和野生型比更少,第一次产仔时间和胎次间隔时间也更长,也就是说Pappa2基因敲除后小鼠的繁殖力下降。

同年,在荷斯坦奶牛上发现Pappa2基因和奶牛的繁殖健康有关,并且鉴定出了一个SNP和奶牛的繁殖性状和生产性状相关。

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