[发明专利]鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的PCR引物及其鉴别方法以及应用在审
申请号: | 201810848554.5 | 申请日: | 2018-07-28 |
公开(公告)号: | CN108950070A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 陈翠腾;黄瑜;陈珍;朱春华;刘斌琼;蔡国漳 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6858;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京中济纬天专利代理有限公司 11429 | 代理人: | 张磊 |
地址: | 350013 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 腺病毒 鉴别 引物 限制性内切酶 上游引物F 下游引物R 病毒样本 酶切产物 特异性强 准确率 扩增 酶切 应用 | ||
1.一种鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的PCR引物,其特征在于:所述引物的序列如下:
上游引物F:5’-GCTAGACAGATCGAGGGAGG-3’
下游引物R:5’-GAAGAAGAGCAGAGTTGGCG-3’。
2.一种鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的方法,其特征在于:
利用上游引物F:5’-GCTAGACAGATCGAGGGAGG-3’和下游引物R:5’-GAAGAAGAGCAGAGTTGGCG-3’,以待检病毒样本的DNA为模板,进行PCR扩增,之后利用限制性内切酶SpeⅠ对PCR扩增产物进行酶切,根据琼脂糖凝胶电泳观察酶切产物的片段数,特异性地对鸭腺病毒B型和鸭腺病毒C型进行鉴别诊断。
3.根据权利要求2所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的方法,其特征在于:它包括以下步骤:
(1)核酸的制备:制备病毒样本的DNA;
(2)PCR扩增反应:
利用上游引物F:5’-GCTAGACAGATCGAGGGAGG-3’和下游引物R:5’-GAAGAAGAGCAGAGTTGGCG-3’,以步骤(1)得到的DNA作为模板,进行PCR扩增反应;所述引物对鸭腺病毒B型的DNA以及鸭腺病毒C型的DNA均可扩增,扩增条带大小均为459bp;
(3)PCR产物的酶切:
将步骤(2)扩增的PCR产物进行SpeⅠ酶切反应;
(4)琼脂糖凝胶电泳:
对步骤(3)酶切所得的产物进行琼脂糖凝胶电泳;观察琼脂糖凝胶电泳,鸭腺病毒B型的DNA扩增的PCR产物经SpeⅠ限制性内切酶酶切后,可切成2条片段,1条大小为286bp,另1条大小为173bp;鸭腺病毒C型的DNA扩增的PCR产物经限制性内切酶SpeⅠ酶切后没有变化,还是原来PCR产物的片段,即大小为459bp的片段;对于鸭腺病毒B型的DNA和鸭腺病毒C型的DNA混合扩增的PCR产物经限制性内切酶SpeⅠ酶切后,琼脂糖凝胶电泳可显示3条片段,其中1条大小为459bp的片段是鸭腺病毒C型的DNA经PCR扩增后未被SpeⅠ酶切开的产物;另2条片段是鸭腺病毒B型的DNA扩增的PCR产物经SpeⅠ酶酶切后的产物,且2条片段中,1条大小为286bp,另1条大小为173bp。
4.根据权利要求3所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的方法,其特征在于:步骤(2)所述PCR扩增反应的优化体系为:在50μL体系中含有以下成分:
5.根据权利要求3所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的方法,其特征在于:步骤(2)所述PCR扩增反应的反应条件为:94℃5min,预变性;94℃30s,53℃30s,72℃30s,共35个循环;72℃10min;10℃hold。
6.根据权利要求3所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的方法,其特征在于:步骤(3)所述酶切反应的体系为:在30μL体系中含有以下成分:
7.根据权利要求3所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的方法,其特征在于:步骤(3)所述酶切反应的反应条件为:37℃水浴反应5min。
8.根据权利要求1所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的PCR引物的应用,其特征在于:在制备区分鸭腺病毒C型与鸭腺病毒B型试剂盒上的应用。
9.根据权利要求1所述的鉴别鸭腺病毒C型和鸭腺病毒B型的PCR引物的应用,其特征在于:在检测鸭腺病毒C型与鸭腺病毒B型感染情况方面的应用。
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