[发明专利]一种与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记及其检测方法在审
申请号: | 201810863235.1 | 申请日: | 2018-07-31 |
公开(公告)号: | CN108676899A | 公开(公告)日: | 2018-10-19 |
发明(设计)人: | 黄瑞华;马翔;李平华;张倩;贺丽春;方宇瑜;将能静;陆志强;黄媛 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;徐冬涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 二花脸母猪 染色体 产仔 品系 位点 性状 检测 高产 核苷酸序列 参考序列 产仔性能 蛋白基因 上游引物 下游引物 猪基因组 核苷酸 同线 引物 仔数 筛选 | ||
1.一种与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列13号染色体上g.80866929核苷酸位点,且存在A/G多态性,所述SNP标记与二花脸母猪窝经产产活仔数和窝经产总产仔数极显著相关。
2.一种基于权利要求1所述的SNP开发分子标记的方法,其特征在于以含有权利要求1所述的SNP标记的核苷酸序列为基础序列,设计引物对,以二花脸母猪基因组DNA为模板进行PCR扩增,使权利要求1所述的SNP标记转化为分子标记。
3.根据权利要求21所述的方法,其特征在于所述的引物对序列为上游引物:SEQ IDNO:2,下游引物:SEQ ID NO:3;所述的分子标记序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位点位于第257位,存在A/G多态性。
4.按照权利要求2或3的方法得到的分子标记。
5.根据权利要求4所述的分子标记,其特征在于分子标记序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位点位于第257位,存在A/G多态性。
6.一种用于检测权利要求1所述的SNP标记的引物对,其特征在于上游引物为:SEQ IDNO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。
7.一种检测权利要求1所述的SNP标记的方法,其特征在于包含PCR扩增二花脸母猪基因组中含有权利要求1所述的SNP标记的一段序列,对扩增产物进行测序,判读该位点的A/G多态。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)取一头二花脸母猪的耳组织样品并提取总DNA;
(2)用已提取的二花脸母猪基因组DNA为模板,使用权利要求5所述的引物进行PCR扩增;
(3)扩增产物测序,分析测序结果,判读在SEQ ID NO:1第257位的A/G多态性。
9.权利要求1所述的SNP标记、权利要求4或5所述的分子标记、权利要求6所述的引物在筛选高产二花脸母猪品系中的应用。
10.一种筛选高产二花脸母猪品系的方法,其特征在于包括检测二花脸母猪国际猪基因组11.1版本参考序列13号染色体上g.80866929核苷酸位点的基因型,选育g.80866929核苷酸位点基因型为AA型的个体作为种猪。
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