[发明专利]产生用于纳米孔传感器的双层的方法在审
申请号: | 201810865708.1 | 申请日: | 2013-02-15 |
公开(公告)号: | CN108949944A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 兰德尔·戴维斯;R·陈 | 申请(专利权)人: | 吉尼亚科技公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人: | 牟静芳;郑霞 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物芯片 纳米孔传感器 纳米孔 脂双层 电极 测序 分箱 分选 核酸 可用 申请 蛋白质 邻近 检测 制造 | ||
1.一种用于检测靶分子的方法,其包括:
(a)提供在邻近或靠近感测电极设置的膜中包含纳米孔的芯片;
(b)引导核酸分子穿过所述纳米孔,其中所述核酸分子与报道分子相关联,其中所述核酸分子包含地址区域和探针区域,其中所述报道分子与所述核酸分子在所述探针区域相关联,并且其中所述报道分子与靶分子偶联;
(c)在引导所述核酸分子穿过所述纳米孔的同时对所述地址区域进行测序,以确定所述地址区域的核酸序列;及
(d)在计算机处理器的辅助下,基于在(c)中确定的所述地址区域的核酸序列,鉴别所述靶分子。
2.如权利要求1所述的方法,其中通过报道分子与所述核酸分子的探针区域的结合,将(b)中的探针分子保持在所述孔中。
3.如权利要求2所述的方法,其中当所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率降低时,所述核酸分子的最多三个碱基得到鉴别。
4.如权利要求2所述的方法,其中当所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率降低时,所述核酸分子的最多五个碱基得到鉴别。
5.如权利要求2所述的方法,其中在所述报道分子与所述纳米孔相互作用时,所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率降低。
6.如权利要求1所述的方法,其中在(b)中,所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率停止或停顿。
7.如权利要求1所述的方法,其还包括,在(d)之前,确定所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率是否已经降低。
8.如权利要求1所述的方法,其中,在(d)中,若确定所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率已经降低,则所述靶分子得到鉴别。
9.如权利要求1所述的方法,其中,在(d)中,基于(i)所述地址区域的核酸序列和关联与(ii)所述核酸分子通过所述纳米孔的前进速率之间的相关性,鉴别所述靶分子。
10.如权利要求1所述的方法,其中所述纳米孔为可单独寻址的。
11.如权利要求1所述的方法,其中所述核酸分子是单链的。
12.如权利要求1所述的方法,其还包括将所述核酸分子捕获于所述纳米孔中。
13.如权利要求12所述的方法,其中在形成于所述核酸分子的一个或多个端部的大体积结构的辅助下,所述核酸分子被捕获于所述纳米孔中。
14.如权利要求12所述的方法,其中在附着于所述核酸分子的一个或多个端部的大体积结构的辅助下,所述核酸分子被捕获于所述纳米孔中。
15.如权利要求1所述的方法,其还包括逆转所述核酸分子穿过所述纳米孔的流动方向。
16.如权利要求15所述的方法,其还包括当逆转所述核酸分子的流动方向时,对所述地址区域的至少一部分进行重新测序。
17.如权利要求1所述的方法,其中所述报道分子在所述报道分子的端部包含抗体或适体,并且其中所述抗体或适体与所述靶分子相关联。
18.如权利要求1所述的方法,其中地址区域和探针区域具有已知的核酸序列。
19.如权利要求1所述的方法,其中所述报道分子包含与所述探针区域的核酸序列互补的核酸序列。
20.如权利要求1所述的方法,其中在被引导穿过所述纳米孔之前,所述核酸分子与所述报道分子相关联。
21.如权利要求1所述的方法,其中,在(b)之前,所述核酸分子穿过所述纳米孔,并且其中,在(b)中,所述报道分子与已穿过所述纳米孔的所述核酸分子相关联。
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