[发明专利]人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备及其检测方法在审
申请号: | 201810916358.7 | 申请日: | 2018-08-13 |
公开(公告)号: | CN108977501A | 公开(公告)日: | 2018-12-11 |
发明(设计)人: | 魏书琴;尹锐;卢广林;陈海蛟;李宛泽;冯立超 | 申请(专利权)人: | 吉林农业科技学院 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6895;C12Q1/6848;G01N33/577;G01N33/569 |
代理公司: | 北京君泊知识产权代理有限公司 11496 | 代理人: | 王程远 |
地址: | 132101 吉林省吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黑斑 核酸传感器 制备 人参 巢式PCR 单管 硝酸纤维素膜 底板 检测灵敏度 胶体金颗粒 金标结合垫 链酶亲和素 人参黑斑病 真菌培养物 基因组DNA 快速检测 常规PCR 检出限 胶体金 培养物 吸水纸 样品垫 扩增 破碎 组装 检测 优化 | ||
1.人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
A、制备人参黑斑菌真菌培养物;
B、对培养物破碎并进行DNA提取;
C、人参黑斑菌16S rRNA扩增;
D、胶体金的制备;
E、胶体金颗粒与链酶亲和素的结合;
F、核酸传感器的制备与组装。
2.如权利要求1所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的步骤B中,所述的DNA提取方法为磁珠法或者CTAB法;优选的,所述的DNA提取方法为磁珠法。
3.如权利要求1所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的人参黑斑菌16S rRNA扩增:根据李烨报道的人参黑斑菌特异引物进行人参黑斑菌DNA的扩增,引物序列如下,5’-CCTGCGGAGGGATCATTACACA-3’;5’-ACGCTGACCTTGGCTGGAAGA-3’,扩增目的条带大约为475bp,引物由上海生物工程有限公司合成;PCR反应体系为15μL的PCR Mix,1μL的基因组DNA,各引物均1μL 10μM,加入双蒸馏水定容到系统总体积25μL;PCR的扩增条件为:95℃预变性2min,95℃变性1min55℃退火45s,72℃延伸45s,共35个循环,4℃保存;将5μL PCR产物通过2%琼脂糖凝胶电泳检测。
4.如权利要求1所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的胶体金的制备方法,包括以下步骤:称取100mL双蒸水于平底烧瓶中,在电炉上加热至沸腾;加入1.0mL 1%HAuCl4溶液,继续加热,加入1.25mL 2%的柠檬酸三钠,继续煮沸;溶液将依次由浅黄色变为灰色、黑色、紫色,最后为酒红色,继续搅拌,5min后取出烧杯;待胶体金冷却至室温时,补充至原先的体积;将瓶身用铝箔纸包裹,4℃避光保存即可。
5.如权利要求1所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的胶体金颗粒与链酶亲和素的结合,包括以下步骤:
a、取10mL胶体金,调pH至7.0,在搅拌状态下,加入SA至最佳标记量,在室温下反应30min;加入100μL 10%BSA,继续搅拌10min;加入200μL 10%(W/V)BSA进行封闭,缓慢颠倒混匀10min;
b、再加入200μL 10%(W/V)PEG进行二次封闭,缓慢颠倒混匀10min;
c、随后,9000rpm 4℃离心30min,弃上清,得到胶体金-SA结合物,用5mL金标稀释液复溶,铺在玻璃纤维上,37℃烘干过夜,密封干燥保存,即可得到胶体金颗粒-链霉亲和素复合物。
6.如权利要求5所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的金标稀释液,由以下成分组成:硼砂,硼酸,0.5%Casein,2.5%蔗糖,0.1%PEG,0.1%TritonX-100和0.05%NaN3。
7.如权利要求1所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的核酸传感器的制备与组装,包括以下步骤:将胶体金颗粒-链霉亲和素复合物铺于金标结合垫;将鼠抗Fam单克隆抗体和BSA-生物素铺于硝酸纤维素滤膜的T线和C线;取底板作为支撑,底端粘贴样品垫,顶端粘贴吸水垫,中间粘贴硝酸纤维素滤膜,组装完成,试纸条切刀裁剪成合适尺寸,装入含有干燥剂的铝箔袋中密封保存,标明制备日期、名称,即可。
8.如权利要求7所述的人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的制备方法,其特征在于,所述的核酸传感器,由底板、硝酸纤维素膜、金标结合垫、样品垫和吸水纸五部分组成。
9.人参黑斑菌-单管巢式PCR-核酸传感器的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一:通过外引物F1和R1对靶DNA进行PCR扩增;随后在同一反应管中内引物F2和R2以一扩的PCR产物为模板进行巢式PCR扩增;其中,F2在序列的5'端用Fam标记;
步骤二:PCR扩增结束后,PCR扩增子经高温变性,变性的Fam标记的单链DNA与Biotin修饰的特异性核酸探针在46℃下杂交,形成被Fam和Biotin标记的三明治样夹心复合物;
步骤三:将5μL杂交物上样于核酸传感器的样品垫;随后,将核酸传感器下部吸水垫浸入95μL的展开液中;在展开液作用下,复合物中的Biotin位点与金标结合垫中链霉亲和素-胶体金复合物结合,形成新复合物,并在展开液作用下自下而上层析,当到达T线时被包被的鼠抗-Fam单克隆抗体捕获,反应过程中由于胶体金颗粒在检测线的大量富集,形生可见的红色条带;过剩的胶体金-链霉亲和素继续层析至C线,被C线的Biotin捕获,C线可形成可见的红色条带,此时,检测结果呈阳性;若仅C线显红色,则结果呈阴性;若T线和C线均无色,表明核酸传感器已经失效。
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