[发明专利]放化疗损伤相关的DNA分子标记的筛选方法和试剂盒

说明书

本发明提供了一种放化疗损伤相关的DNA分子标记的筛选方法和试剂盒，涉及生物技术领域。该方法通过先提供一组放化疗损伤样品；然后检测所述样品的候选DNA分子标记的位点信息；再建立以DNA分子标记位点信息为自变量，放化疗损伤的程度为因变量的多元线性回归数学模型；然后计算所述多元线性回归数学模型的有效变量和有效变量的相关系数；其中，所述有效变量为放化疗损伤相关的DNA分子标记；所述有效变量的相关系数为筛选出的放化疗损伤相关的DNA分子标记的权重系数，缓解了现有技术中存在的缺少一种能够有效筛选与放化疗损伤相关的DNA分子标记的方法的技术问题。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其是涉及一种放化疗损伤相关的DNA分子标记的筛选方法和试剂盒。

背景技术

放、化疗是双刃剑，杀灭癌细胞的同时，不可避免地也要对机体造成损伤。肺癌在我国是男性第一高发女性第二高发肿瘤，同时也是我国致死人数最多的肿瘤。放射性治疗是肿瘤治疗的一种重要技术手段，随着技术的进步，对于肺癌的治疗，放疗的治疗效果已经可以比拟手术治疗的效果，同时放疗对患者身体的损伤小，治疗后患者的生活质量好，而且平均治疗所需的成本也比手术治疗要低。伴随着国民经济的发展，可以预见将会有更多的医疗机构会引入先进的放疗设备，同时人民对生活质量需求的提高，放疗将会逐渐在肿瘤治疗的领域将会起到越来越重要的作用。

参与放射性损伤的各种细胞因子、酶等均离不开基因的调控，不同的基因型可影响正常组织对射线的敏感性，因此从基因水平上研究放化疗损伤可以更本质的了解放化疗损伤的发病机理。DNA分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是直接在DNA分子上检测生物间的差异，是DNA水平变异的直接反应，DNA分子标记不受环境基因表达与否的限制，数量极多，遍及整个基因组，多态性高，遗传稳定，但是由于DNA分子标记数量过大，很难筛选出与研究目的相关的DNA分子标记。

因此，一种筛选与放化疗损伤相关的DNA分子标记方法，使放化疗损伤的程度与基因水平的表现相关联，是目前有待解决的问题。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的第一目的在于提供一种放化疗损伤相关的DNA分子标记的筛选方法，缓解了现有技术中存在的缺少一种能够有效筛选与放化疗损伤相关的DNA分子标记的方法的技术问题。

本发明的第二目的在于提供一种用于预测放化疗损伤的试剂盒，缓解了现有技术中存在缺少一种能够有效预测放化疗损伤的产品的技术问题。

为解决上述技术问题，本发明特采用如下技术方案：

一种放化疗损伤相关的DNA分子标记的筛选方法，先提供一组放化疗损伤样品，然后检测所述样品的候选DNA分子标记的位点信息；

再建立以DNA分子标记位点信息为自变量，放化疗损伤的程度为因变量的多元线性回归数学模型；然后计算所述多元线性回归数学模型的有效变量和有效变量的相关系数；

其中，所述有效变量为放化疗损伤相关的DNA分子标记；所述有效变量的相关系数为筛选出的放化疗损伤相关的DNA分子标记的权重系数。

优选地，所述DNA分子标记包括SNP标记；

优选地，候选SNP标记的个数为1×10⁵-10×10⁵个；优选5×10⁵-8×10⁵个；更优选6.5×10⁵-7.5×10⁵个。

优选地，计算所述多元线性回归数学模型的有效变量和有效变量的相关系数基于Lasso和弹性网络正则化的广义线性模型的算法。

优选地，使用基因测序法、基因芯片分型法或Q-PCR的方法检测放化疗损伤样品的DNA分子标记的位点信息；