[发明专利]一种细胞模型构建方法及微流控分选仿真方法有效
申请号: | 201810942187.5 | 申请日: | 2018-08-17 |
公开(公告)号: | CN109147864B | 公开(公告)日: | 2022-03-22 |
发明(设计)人: | 黄志刚;黄亚军;彭浩宇;蔡文莱;王富盛 | 申请(专利权)人: | 广东工业大学 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B15/00 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 张春水;唐京桥 |
地址: | 510006 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 模型 构建 方法 微流控 分选 仿真 | ||
1.一种细胞模型构建方法,其特征在于,应用于微流控技术领域,包括:
生成多个DOPC磷脂分子模型和多个水分子模型;
以多个所述DOPC磷脂分子模型构建磷脂双分子层模型,具体包括:构建出内层、外层的磷脂分子模型并进行均匀化处理,将内层与外层的磷脂分子模型进行组合;
以所述磷脂双分子层模型与多个所述水分子模型构建细胞模型,所述细胞模型将磷脂双分子层外的其他部分简化为水分子;
所述水分子模型具体为内部嵌入偶极子的粗粒化粒子;
所述以所述磷脂双分子层模型与多个所述水分子模型构建细胞模型具体包括:
以多个所述水分子模型构建细胞内液模型和细胞外液模型,以所述磷脂双分子层模型、所述细胞内液模型与所述细胞外液模型构建细胞模型。
2.根据权利要求1所述的细胞模型构建方法,其特征在于,所述DOPC磷脂分子模型中粗粒化粒子间的横向间距为2.125埃、纵向间距为2埃,组成所述DOPC磷脂分子模型中的粗粒化粒子具体为胆碱、磷酸盐、甘油、酯基和碳氢化合物。
3.一种微流控芯片的分选仿真方法,其特征在于,包括步骤:
S1、根据设定的芯片参数,构建分选芯片模型;
S2、调用如权利要求1至2任一项所述的细胞模型构建方法构建的细胞模型并置于所述分选芯片模型中;
S3、引入ELBA力场;
S4、引入流场,使所述细胞模型在所述分选芯片模型中流动,以进行分选仿真。
4.根据权利要求3所述的微流控芯片的分选仿真方法,其特征在于,所述步骤S3之后所述步骤S4之前还包括:
将所述细胞模型置于预设弛豫空间中进行弛豫;
若弛豫后的所述细胞模型未破裂,进入所述步骤S4。
5.根据权利要求4所述的微流控芯片的分选仿真方法,其特征在于,所述预设弛豫空间具有周期性边界且温度恒定在300K。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述根据设定的芯片参数,构建分选芯片模型具体包括:
根据设定的芯片尺寸、微柱半径及微柱位置信息,构建具有周期性边界的分选芯片模型。
7.一种用于实施如权利要求1或2所述细胞模型构建方法的细胞模型构建装置,其特征在于,包括:
模型生成模块,用于生成多个DOPC磷脂分子模型和多个水分子模型;
磷脂双分子层模型构建模块,用于以多个所述DOPC磷脂分子模型构建磷脂双分子层模型;
细胞模型构建模块,用于以所述磷脂双分子层模型与多个所述水分子模型构建细胞模型。
8.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质用于存储程序代码,所述程序代码用于执行权利要求1至2任一项所述的细胞模型构建方法或用于执行权利要求3至6任一项所述的微流控芯片的分选仿真方法。
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