[发明专利]检测图像上的亮斑的方法和装置、图像配准方法和装置

说明书

本发明公开了一种对图像上的亮斑进行检测的方法和装置、一种图像配准方法及装置。所称的图像来自发生碱基延伸反应的一个视野，发生碱基延伸反应的该视野上存在多个带有光学可检测标记的核酸分子，至少一部分核酸分子在图像上表现为亮斑，图像上的亮斑检测方法包括：利用k1*k2矩阵对图像上的亮斑进行检测，判定矩阵的中心像素值不小于第一预设值、矩阵非中心任一像素值不小于第二预设值并且矩阵的中心像素值不小于该矩阵非中心任一像素值的矩阵对应一个候选亮斑，k1和k2均为大于1的奇数，k1*k2矩阵包含k1*k2个像素点；以及确定候选亮斑是否为所称的亮斑。该方法能够快速有效地实现图像上的亮斑的准确检测，特别是对采集自核酸序列测定反应的图像。

技术领域

本发明涉及图像处理领域，特别是一种检测图像上的亮斑的方法、一种检测图像上的亮斑的装置、一种包含检测图像上的亮斑的指令的计算机程序产品、一种图像配准方法、一种图像配准装置以及一种包含图像配准的指令的计算机程序产品。

背景技术

在相关技术中，图像上的亮斑定位在基因测序仪和LED灯光点中都有重要应用。

在利用光学成像原理进行序列测定的系统中，例如核酸序列测定，图像分析是很重要的一块，依靠对图像上的亮斑的检测识别、以及将检测识别的亮斑转化成碱基/核苷酸序列以实现核酸序列的测定。图像上亮斑的检测和定位的准确性直接决定了基因测序的准确性。

在核酸序列测定应用中，如何简单、快速和/或有效地检测出图像上的亮斑以及利用该些亮斑信息进行图像处理，有待开发和改进。

发明内容

本发明实施方式旨在至少解决相关技术中存在的技术问题之一或者至少提供一种可选择的实用方案。

依据本发明的一个实施方式，提供一种对图像上的亮斑进行检测的方法，所称的图像采集自发生碱基延伸反应的一个视野，发生碱基延伸反应的该视野上存在多个带有光学可检测标记的核酸分子，至少一部分所称的核酸分子在图像上表现为亮斑，该方法包括：利用k1*k2矩阵对图像上的亮斑进行检测，判定该矩阵的中心像素值不小于第一预设值、该矩阵非中心任一像素值不小于第二预设值并且该矩阵的中心像素值不小于该矩阵非中心任一像素值的矩阵对应一个候选亮斑，k1和k2均为大于1的奇数，k1*k2矩阵包含k1*k2个像素点，所称的第一预设值和/或第二预设值与图像的平均像素值相关；以及确定所称的候选亮斑是否为亮斑。

依据本发明的一个实施方式，提供一种图像配准方法，包括利用图像上的亮斑实现配准，所称图像上的亮斑利用上述本发明实施方式中的亮斑检测方法确定。在一个实施方式中，该配准方法包括：基于参考图像对待配准图像进行第一配准，所述参考图像和所述待配准图像对应相同视野，包括确定所述待配准图像上的预定区域和所述参考图像上的相应预定区域的第一偏移量，基于所述第一偏移量移动所述待配准图像上的所有亮斑，获得第一配准后的待配准图像；基于所述参考图像对第一配准后的待配准图像进行第二配准，包括合并所述第一配准后的待配准图像和所述参考图像，获得合并图像，计算所述合并图像上的预定区域的所有重合亮斑的偏移量，以确定第二偏移量，距离小于预定像素的两个或多个亮斑为一个所述重合亮斑，基于该第二偏移量移动所述第一配准后的待配准图像上的所有亮斑，以实现对所述待配准图像的配准。

依据本发明的一个实施方式，提供一种计算机可读存储介质，用于存储供计算机执行的程序，执行所述程序包括完成上述任一实施方式中的图像上的亮斑检测和/或图像配准方法。计算机可读存储介质可以包括：只读存储器、随机存储器、磁盘或光盘等。

依据本发明的又一个实施方式，提供一种计算机程序产品，该产品包括实现图像上的亮斑的检测的指令，该指令在计算机执行程序时，使计算机执行上述本发明实施方式中的亮斑检测方法的部分或所有步骤。

依据本发明的再一个实施方式，提供一种计算机程序产品，该产品包括实现图像配准的指令，指令在计算机执行程序时，使计算机执行上述本发明实施方式中的图像配准方法的部分或所有步骤。