[发明专利]PTCH2基因突变位点在判断年轻乳腺癌易感性中的应用

说明书

本发明公开了PTCH2基因突变位点的用途，该突变位点为p.S391X(SNP rs56126236)。本发明首次发现了上述突变位点与年轻乳腺癌易感性相关，因此在此基础上提出一种通过检测突变来诊断年轻乳腺癌易感风险性的产品，该产品具有灵敏性、特异性，能够对正常人群进行乳腺癌易感性的筛查，有效起到风险预测、早期诊断的作用。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及PTCH2基因突变位点的用途，具体涉及PTCH2基因突变位点在判断年轻乳腺癌易感性中的应用。

背景技术

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤，我国女性乳腺癌发病率逐年增高，发病率占恶性肿瘤的7％～10％，全年约120万妇女发生乳腺癌，占女性肿瘤的18％。

经研究，BRCA1与BRCA2基因的胚系突变很大程度上增加了女性患有乳腺癌的风险。在正常情况下，这两个基因主要参与DNA的同源重组修复。如果它们出现有害变异，细胞就会无节制地增殖导致癌症形成。然而，BRCA1和BRCA2只能解释部分家族性乳腺癌的遗传，且中国BRCA1和BRCA2的突变频率低于欧美国家。

单核苷酸多态性(SNP)是指由于单个核苷酸的变异而引起基因组水平上的DNA序列多态性，形式包括单碱基的缺失、插入、转换及颠换等。一般而言，上述形式中最少1种等位基因在群体中的频率不小于1％，但在某种特殊情况下(如cDNA中)也可以小于1％。1个SNP在基因组某个位点上有单个核苷酸的变化，主要由两种形式出现：一种是单个碱基的转换所引起，即以一种嘧啶置换另一种嘧啶或一种嘌呤置换另一种嘌呤；另外一种形式就是颠换，即嘌呤与嘧啶互换。从原理上分析，突变处的碱基可以是C、G、A、T，而实际上SNP多发生在T和C之间。人类遗传基因的多态性在遗传信息上的本质表现，90％以上是由SNP所引起的。因为其多肽信息量大，目前已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志。

SNP标记作为目前最具发展潜力的分子标记，因其在基因组中数量多、分布广且在基因分析过程中不需要根据片段大小将DNA分带，即可实现大规模高自动化，因而更适合于数量庞大的检测分析，已被广泛应用于生物、农学、医学、生物进化等众多领域。SNP的研究为基因诊断，尤其是疾病的早期诊断提供更多的依据。SNP由于其分布广、密度高而被期望在诸如癌症、糖尿病、高血压、抑郁症和哮喘等复杂疾病中起重要作用，这些复杂疾病是多个遗传变异位点与环境因子共同作用的结果，由于发病原因复杂，涉及的基因数量多，已成为国际上疾病基因组学研究的重点。目前已有实验将SNP应用于肿瘤预后及易感性的判断，例如肺癌致癌物的易感性存在个体差异，即肺癌的基因易感性，研究较多的是代谢酶基因多态性，如人细胞色素P450-CYP450和髓过氧化酶MPO等。通过传统的候选基因研究法，对与乳腺癌发生功能相关的基因进行测定，也发现了许多易感基因，如内皮糖蛋白基因、基质金属蛋白酶基因、IR型胶原基因、otl-抗胰蛋白酶基因、弹力蛋白基因、血管紧张素转化酶基因、载脂蛋白基因等，尽管发现了上述相关基因，但是对基因的研究目前只停留在实验阶段，目前临床上用于年轻乳腺癌筛查的易感基因较少。

发明内容

为了弥补现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种可用于诊断乳腺癌易感性的突变位点。通过检测突变存在与否来诊断乳腺癌具有预警性。

为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：

本发明提供了检测PTCH2基因的SNP位点的试剂在制备诊断乳腺癌易感性的产品中的用途。

进一步，所述PTCH2基因的SNP位点为rs56126236。其中，PTCH2的SNP位点rs56126236存在CT缺失时，乳腺癌的易感性增加。

本领域技术人员能通过检测SNP位点的任何方法或技术来检测PTCH2基因SNP位点。例如，Taqman法、质谱法、DNA微阵列法、测序法、微测序、杂交、限制性片段分析、寡核苷酸连接检测、等位基因特异性PCR-HRM或联合应用上述方法。因此，本发明的所述试剂包括利用以上方法检测PTCH2基因SNP位点的试剂。