[发明专利]用于检测rs4244285的引物探针组及其应用

说明书

本发明公开了一种用于检测rs4244285的引物探针组及其应用。本发明首先保护一种引物探针组，由引物MF、引物WF、引物R和探针P组成；引物MF为序列表的序列1所示的单链DNA分子；引物WF为序列表的序列2所示的单链DNA分子；引物R为序列表的序列3所示的单链DNA分子；探针P为一个末端具有荧光基团且另一个末端具有荧光淬灭基团的单链DNA分子，DNA分子的核苷酸序列为序列表的序列4所示。本发明可用于检测rs4244285，判断待测样本基于该位点的基因型，从而指导用药，具有重大的应用推广价值。

技术领域

本发明涉及一种用于检测rs4244285的引物探针组及其应用。

背景技术

细胞色素P450（Cytochrome P450或CYP450,简称CYP450）代表着一个很大的可自身氧化的亚铁血红素蛋白家族，属于单氧酶的一类，因其在450纳米有特异吸收峰而得名。它参与内源性物质和包括药物、环境化合物在内的外源性物质的代谢。根据氨基酸序列的同源程度，其成员又依次分为家族、亚家族和酶个体三级。细胞色素P450酶系统可缩写为CYP，其中家族以阿拉伯数字表示，亚家族以大写英文字母表示，酶个体以阿拉伯数字表示，如CYP2D6、CYP2C19、CYP3A4等。人类肝细胞色素P450酶系中至少有9种P450与药物代谢相关。

肝脏是人体重要的解毒器官，许多药物都经肝脏代谢，细胞色素P450是主要的肝细胞Ⅰ相代谢酶之一。在CYP2C亚家族中，CYP2C19亚型对药物反应起着关键性的作用，因为它们的活性存在显著的个体差异，表现为遗传多态性，可以使人产生血药浓度的显著个体差异。

CYP2C19是CYP450酶第二亚家族中的重要成员，是人体重要的药物代谢酶，在肝脏中有很多表达。CYP2C19基因位于人类10号染色体上,cDNA全长1940bp,共编码490个氨基酸。CYP2C19具有很多SNP位点，至少存在14种突变基因和18种等位基因突变，主要包括CYP2C19*1，CYP2C19*2，CYP2C19*3，CYP2C19*17。编码正常酶活性的基因是CYP2C19*1。CYP2C19*2和CYP2C19*3等位基因占东方人弱代谢表型(PM)的99％以上，其编码的酶无活性。CYP2C19*2是由于第5位外显子第681位碱基发生G→A突变,形成一个异常剪切位点,使得在转录时第5位外显子起始端丢失40个碱基对(643-682bp)，从而在核糖体翻译时丢失了第215-227位氨基酸,导致第215位氨基酸起始阅读框架发生移动,由此在第215位氨基酸下游第20个氨基酸处提前产生1个终止密码子,使得蛋白合成过早被终止,导致这一截短的含234个氨基酸的蛋白质丧失了催化活性。由此导致的慢代谢在中国人中的发生率约为30%。

根据CYP2C19基因基因型,人群中对药物氧化代谢能力可分为2种表型,一种为强代谢者(extensive metabolizer,EM),另一种为弱代谢者(poor metabolizer,PM)。正常人群对某一类药物的代谢一般表现为强代谢,弱代谢则主要是由于2个等位基因的突变和(或)缺失引起的表型改变。由于不同个体存在药物代谢方面的差异,因而给药后可能会出现严重的毒副作用或药物剂量不足,从而导致治疗的失败。CYP2C19主要参与代谢的药物谱也较为广泛,其大致有质子泵抑制剂、三环类抗抑郁药、抗癫痫药、抗精神病药、降糖药、抗凝药、抗疟疾药以及一些抗癌药物等。

CYP2C19的遗传多态性影响着许多临床药物的代谢,其活性存在明显的个体差异,对不同个体的药物治疗作用和不良反应及药物的毒性具有重要影响。据统计，CYP2C19*2和CYP2C19*3两个突变位点能解释几乎100%的东亚人和85%的高加索人种的相关弱代谢遗传缺陷，CYP2C19*2和CYP2C19*3在亚洲发生突变的频率较高,在中国人群中约占30%,与药物代谢关系最为密切。