[发明专利]基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的引物及其试剂盒与方法在审
申请号: | 201810979697.X | 申请日: | 2018-08-24 |
公开(公告)号: | CN109055612A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
发明(设计)人: | 李丽丽;孟赫诚;刘雨琦;石磊;温雯 | 申请(专利权)人: | 暨南大学;华南理工大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 王会龙 |
地址: | 510632 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 猪圆环病毒2型 试剂盒 检测 待检样品 引物 总DNA提取 病毒诊断 阳性对照 阴性对照 引物组合 荧光信号 有效控制 超纯水 变温 扩增 微滴 灵敏 病毒 配置 预防 治疗 发现 | ||
1.一种基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的引物,包括内引物FIP和BIP,外引物F3和B3,环引物LF和LB,其核苷酸序列分别如下所示:
外引物F3:AAGGCAACTTACTGATAGAATGT
外引物B3:TCCTCCGTGGATTGTTCT
内引物FIP:GCAACGGTCACCAGACTCCACAACGGAGTGACCTCT
内引物BIP:CCGCAGTATTCTGATTACCAGCAGGAAGTAATCCTCC
GATAGAGA
环引物LF:TCCAACAAGGTACTCACAGC
环引物LB:TTGGAATGGTACTCCTCAACTG。
2.如权利要求1所述的基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的引物,其特征在于:扩增反应时,内引物FIP和BIP,环引物LF和LB和外引物F3和B3的摩尔比为8:4:1。
3.一种基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的试剂盒,其特征在于,试剂盒包含权利要求1或2中所述的引物。
4.如权利要求3所述的基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的试剂盒,其特征在于,还包括以下成分的部分或者全部:(1)2×ddLAMP Supermix;(2)无RNA酶的超纯水;(3)阳性对照和阴性对照;(4)病毒总DNA提取试剂。
5.如权利要求4所述的基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的试剂盒,其特征在于:所述2×ddLAMP Supermix包含以下试剂:内引物FIP和BIP各160μmol/L,外引物F3和B3各80μmol/L,环引物LF和LB各160μmol/L,1×TE,50mmol/L Tris-HCl(pH8.8),250mmol/L KCl,200mmol/L MgSO4,250mmol/L(NH4)2SO4,2.8%Tween-20,7.14mol/L甜菜碱,10mmol/LdNTP,Bst大片断DNA聚合酶160U,20×EvaGreen,RNase Cocktail。
6.如权利要求4所述的基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的试剂盒,其特征在于:阳性对照为猪猪圆环病毒2型DNA,阴性对照为去离子水。
7.一种基于数字LAMP技术检测猪圆环病毒2型的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)病毒DNA的提取
1)取待检样品1g,加入600μL裂解液A研磨后,涡旋混匀20秒,室温静置10分钟;
2)将混合液移至吸附柱中,12,000×g离心30~60秒;
3)丢弃收集管中液体,加入500μL洗液B至吸附柱中,12,000×g离心30~60秒;
4)丢弃收集管中液体,加入500μL洗液C至吸附柱中,12,000×g离心30~60秒;
5)丢弃收集管中液体,12,000×g离心2分钟以甩干柱子;
6)将吸附柱移入新的1.5mL离心管中,向柱子中央加入洗脱液50μL,室温静置2分钟,12,000×g离心1分钟,离心管中液体即为模板DNA;
(2)数字LAMP操作
1)待检样品、阴性对照和阳性对照每个反应管各加入数字LAMP反应液19μL;分别取1μL模板DNA,加入相应的反应管中,配置成20μL数字LAMP反应体系;所述模板DNA包括待检样品、阴性对照和阳性对照;
2)将20μL样品反应液加入到微滴发生卡内,制备微滴;
3)将微滴转入PCR板中,放入PCR仪中进行扩增;
4)将扩增完成的PCR板放入微滴分析仪中,检测微滴中的荧光信号,分析数据,显示检测结果;
5)结果判定及描述:阳性对照:40±2个拷贝,阴性对照:<1个拷贝时,实验结果成立;待检测样品结果≥1个拷贝时为阳性;待检测样品结果<1个拷贝时为阴性。
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