[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率的SNP分子标记及其应用。本发明公开的SNP位点为BVRC_BrS2G/A位点，其位于大白菜基因组中的序列表中序列4自5’端第818位核苷酸，该位点为G/A多态。利用本发明所提供的BVRC_BrS2G/A位点及其所对应的引物鉴定大白菜杂交结实率的准确率达85.7％以上。由此表明，本发明所提供的BVRC_BrS2G/A位点及其所对应的引物将有助于杂交结实率高的大白菜种质资源的筛选，可用于分子标记辅助选择育种，为大白菜杂交亲和性性状的遗传改良提供材料储备和技术支持。

技术领域

本发明涉及植物分子育种技术领域，具体涉及一种鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率的SNP分子标记及其应用。

背景技术

自交不亲和性广泛存在于高等植物中，包括70多个科和250多个属。自交不亲和是植物防止近亲繁殖和保持遗传多样性的一种重要的遗传机制，并且已成功应用到甘蓝、菜花、大白菜、小白菜、萝卜等十字花科作物的杂交育种中。芸薹属植物属于典型的孢子体自交不亲和，遗传上由一个具有复等位基因的高度多态性的S位点控制。到目前为止，芸薹属中约有100多个S单元型已经被鉴定，这些S单元型包含与花粉、柱头识别反应相关的3类基因：S位点糖蛋白基因(SLG)、S位点受体激酶基因(SRK)、S位点富半胱氨酸蛋白基因(SCR)和S位点蛋白11基因(SP11)。SLG基因和SRK基因在雌蕊柱头中表达，SP11基因在雄蕊花药中表达。花药中的SP11蛋白与柱头中的SRK蛋白、SLG蛋白发生相互作用，引发不亲和反应的发生。

大白菜作为异花授粉作物，具有明显的杂种优势，其杂种优势的利用主要通过自交不亲和系或雄性不育系配制杂交种来实现。但在实际育种过程中，两个优良自交系(雄性不育系与自交系)在配制杂交种过程中往往会出现杂交结实率低的现象，其主要原因是育种材料同质化愈加严重、血缘基础狭窄等问题造成两个大白菜自交系带有相同的S基因，最终导致不亲和反应的发生。因此，因杂交不亲和而导致大白菜杂交结实率低已严重阻碍了大白菜种子的生产，生产上急需提高大白菜杂交结实率的新方法。

传统的自交(杂交)不亲和的鉴定方法是在田间进行花期人工自交或杂交，然后通过调查授粉花数和结籽数来测定自交或杂交亲和性，这种方法不仅费时费力、效率低下、受时间限制，而且结果还易受环境影响。随着分了生物学、生物信息学的发展，对大白菜S基因研究工作也在不断深入，主要集中在S单元型中SLG、SRK、SP11基因序列的多样性分析，S单元型的基因序列也在陆续公布。SNP作为新一代分子标记，具有丰度高、检测易实现自动化等特点，利用上述序列的多态性开发用于检测大白菜杂交结实率的SNP标记已成为可能。基于KASP的SNPline基因分型检测是英国LGC有限公司开发的高通量SNP分型技术，其具有准确、灵活、低成本、高通量的特点，目前已经成为国际上SNP分析的主流方法之一。

发明内容

本发明的目的是提供一种鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率的SNP分子标记及其应用。

本发明首先保护检测大白菜基因组中BVRC_BrS2G/A位点的多态性或基因型的物质的新用途。

本发明提供了检测大白菜基因组中BVRC_BrS2G/A位点的多态性或基因型的物质在如下(1)-(6)任一中的应用：

(1)鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率；

(2)筛选或辅助筛选杂交结实率高的大白菜品种；

(3)大白菜育种；

(4)制备鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率高的产品；

(5)制备筛选或辅助筛选杂交结实率高的大白菜品种的产品；

(6)制备大白菜育种的产品。

上述应用中，所述检测大白菜基因组中BVRC_BrS2G/A位点的多态性或基因型的物质包括由引物1、引物2和引物3所组成的引物组；