[发明专利]与20日龄仔猪红细胞数目相关的分子标记及其应用有效
申请号: | 201811015803.9 | 申请日: | 2018-08-31 |
公开(公告)号: | CN108866210B | 公开(公告)日: | 2021-03-16 |
发明(设计)人: | 刘向东;南九红;赵书红;李新云;杜小勇;尹立林;唐振双;赵志超;朱猛进;张杰 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 张红兵 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 20 仔猪 红细胞 数目 相关 分子 标记 及其 应用 | ||
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及与20日龄仔猪红细胞数目相关的分子标记及其应用。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0016595片段,通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变,且当SEQ ID NO:1上的第101位核苷酸为A时,则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
技术领域
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及20日龄仔猪红细胞数目(RBC)SNP分子标记及其应用。所述的分子标记可用于猪红细胞数目(RBC)性状的预测。
背景技术
近年来,随着现代畜牧业及育种技术的发展,抗病分子育种越来越引起人们的重视。抗病育种,顾名思义,即通过遗传手段提高动物抗病育种的能力。而众所周知,动物的免疫系强弱几乎完全决定了动物抗病能力的强弱(阳建辉等,浅析规模化养猪场疾病发生原因与防疫对策[J],湖南农业科学,2011(1):130-133)。所以找到与动物免疫功能相关的分子标记对于动物的抗病育种而言至关重要。
红细胞,作为动物血细胞中数目最多的部分,在动物呼吸功能及新陈代谢中扮演着重要角色,另外,早在上个世纪便有多个研究表明红细胞在动物的免疫功能中发挥着不可或缺的作用(郭峰.红细胞免疫研究概况[J].中华微生物学和免疫学杂志,1995(3):181-182)。最早是Nelson在人类中观察到了免疫黏附现象,并据此推测在人类的红细胞上存在免疫受体,其有助于生成免疫复合物,从而促进白细胞的吞噬作用,而后来大量的研究也确实证实了Nelson的推断(王旭东等,猪红细胞免疫功能初步研究[J],西北民族大学学报(自然科学版),1992(1):9-12)。红细胞在清除循环免疫复合体中具有重要作用,有研究表明82%-84%的抗原-抗体-补体复合物是结合在红细胞膜上,而只有8.3%-15.2%的结合于中性粒细胞中(郭峰.红细胞免疫学新探(上卷)[M].南京:南京大学出版社,1993:1-32)。另外,红细胞还具有增强动物机体吞噬作用、识别、呈递及消除抗原及扩大免疫的作用(崔恒敏等,动物红细胞免疫功能的研究进展[J].中国兽医科学,2003,33(5):23-27.)。在人类中,红细胞计数是日常体检的一个重要指标,红细胞数目的异常意味着机体患贫血及其他血液病的概率增加。所以,动物的红细胞数目保持在一个合适的水平,对于动物的健康而言是非常重要的。而筛选出与猪红细胞数目相关的分子标记,对于猪免疫功能的提高具有重要作用。全基因组关联分析(GWAS)是近年来发展起来的一种统计方法,其通过对群体的表型及基因型进行统计,通过统计学的方法寻找其相关关系,对于遗传力较高的数量性状而言具有较高的准确性。且有研究表明,红细胞数目的遗传力为0.56(Garner C,Tatu T,Reittie JE,Littlewood T,Darley J,Cervino S,Farrall M,Kelly P,Spector TD,TheinSL:Genetic influences on F cells and other hematologic variables:a twinheritability study.Blood 2000,95(1):342-346.),其属于高遗传力性状。所以本发明中通过全基因关联分析筛选出的与RBC性状显著相关的分子标记对于猪抗病育种具有重要作用。
本发明中发现的SNP与20日龄仔猪RBC性状的相关性达到了显著水平,为家猪免疫性状的研究提供了新的遗传资源。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术存在的缺陷,完善家猪抗病育种分子标记资源的挖掘,利用基因芯片技术对SNP进行分型,并使用GWAS筛选20日龄仔猪红细胞数目(RBC)性状相关的SNP,为猪的抗病育种提供新的分子标记资源。
本发明的技术方案如下所述:
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