[发明专利]一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记

说明书

本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0068286的基因，通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，且当SEQ ID NO：1上的第101位核苷酸为C时，则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。

技术领域

本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。本发明的分子标记可用于猪红细胞数目(RBC)性状的预测。

背景技术

随着我国经济发展步伐不断加快，农业越来越受国家重视，因此养殖业成为了很多人发家致富的重要途径。我国养猪业发展迅速，我国养殖模式逐渐转变为高效低成本的规模化养殖，散养模式逐渐被淘汰(邓奇风等，2017)。与此同时，猪病的发生率不断上升，对环境的污染日益严重，猪肉产品的质量也存在一些问题，越来越严重(章红兵等，2007)。据相关网站资料信息记载，在我国猪猪疫病死因调查统计中，传染病的概率大约占其中60％～70％，因此在养殖过程防疫措施应引起高度重视(郑志洁等，2015)。从新世纪以来，猪疫病的发病频率和种类不断增加。例如猪口蹄疫疾病给养殖业和人类健康造成了严重的危害。除了传统的流行性疾病，像猪瘟、猪丹毒、猪流行性肺炎、猪繁殖障碍疾病、蓝耳病、圆环病毒病等疾病的耐药性逐渐增加，一些新的疾病也陆续的传播到我国(郗爱华等，2015)。例如最近发生在辽宁省沈阳市沈北新区的一起生猪非洲猪瘟疫情引起了大家的很大关注，这是我国首次发生非洲猪瘟疫情。

随着国家监管力度的增加以及大家对食品安全越来越重视，猪的健康养殖刻不容缓，抗病育种已被公认为猪病综合防控的重要环节(王超等，2014)。猪的抗病育种研究具有非常重要的意义，20世纪80年代以来，随着分子生物学和基因工程技术的发展，多种基于DNA水平的多态性分子标记被广泛应用于绘制遗传连锁图谱、遗传多态性分析、定位经济性状基因或QTL中(李晓丽等，2006)。目前猪的抗病育种研究主要集中在抗病性状的候选基因鉴定与特定病(抗)原诱导的宿主基因表达(谱)研究两个方面(朱猛进等，2007)。

本研究中SNP是与猪的红细胞数性状相关，红细胞是血液中数量最多的一种血细胞，同时也是脊椎动物体内通过血液运送氧气的最主要的媒介，同时还具有免疫功能。猪的红细胞数量与其抗病能力具有紧密的联系。其含有CR1、CR3、CD8、CD59、SOD酶等数目众多的免疫分子，在血循环中能够识别、粘附、浓缩、杀伤抗原、清除免疫复合物，对免疫发挥重要作用(郭峰，2002)。随着临床兽医学的快速发展，许多检测技术得到推广应用，血常规检测具有重复性好、方便快捷、高效等特点，可以通过红细胞数来判断猪的健康程度，所以筛选出与猪红细胞数显著相关的分子标记及基因对抗病育种具有重要意义。

本发明中发现的SNP与猪的红细胞数(RBC)的相关性达到了极显著水平，为猪免疫及生长性状的研究提供了新的遗传资源。

发明内容

本发明的目的在于完善家猪抗病育种分子标记，利用基因芯片技术对SNP进行分型，并使用GWAS筛选与猪红细胞数相关的SNP，为猪的抗病育种提供了新的分子标记资源和应用。

本发明的技术方案如下所述：

申请人通过基因分型技术并参阅Ensembl，得到登录号为ASGA0068286基因上下游100bp的核苷酸序列，其核苷酸序列如表SEQ ID NO:1所示。具体序列如下所述：