[发明专利]高效批量优化分子结构的方法有效
申请号: | 201811020752.9 | 申请日: | 2018-09-03 |
公开(公告)号: | CN110875085B | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 高月;张金梅;厉鹏;张向倩;张全;张龑;王睿 | 申请(专利权)人: | 中国石油化工股份有限公司;中石化安全工程研究院有限公司;应急管理部化学品登记中心 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50 |
代理公司: | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人: | 王崇 |
地址: | 北京市朝*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 高效 批量 优化 分子结构 方法 | ||
1.一种高效批量优化分子结构的方法,其特征在于,利用VB编程,实现程序的一次运行完成大批量分子结构的自动优化,用一次程序运行代替多次手动优化计算,具体实现步骤如下:
步骤一、构建分子结构数据库:
对化合物批量优化之前,利用HyperChem软件,绘制分子结构,生成3D分子结构,获得化合物的分子结构数据库,为批量优化分子结构,提供基础的分子结构数据库;同时,将数据库中各化合物的名称储存在文件A中;
步骤二、读取并打开分子结构文件:
通过DDE会话,实现VB和HyperChem之间的通信,VB发出指令,操纵HyperChem选择设置选项,设置分子力学场,读取化合物名称储存文件A中某化合物的名称,打开分子结构数据库里对应的化合物分子结构文件;
步骤三、计算分子结构单点能:
利用HyperChem计算分子结构的单点能;然后将计算得到的分子总能量和能量梯度值返回至VB控件中,并将分子总能量和能量梯度值写入结果文件B中进行储存;
步骤四、分子结构预优化:
利用HyperChem选择分子结构优化选项,在步骤二设置的分子力学方法下进行分子结构预优化,预优化之后,将预优化后分子总能量、能量梯度值和优化计算的拟合结果返回至VB控件中,并将预优化后分子总能量、能量梯度值和优化计算的拟合结果写入结果文件B中进行储存;
步骤五、采用量子力学半经验方法进一步优化分子结构:
采用HyperChem设置计算方法为量子力学半经验方法,然后选择分子结构优化选项进行分子结构的进一步优化,将分子结构的能量梯度值降至以下,优化之后,分子总能量、能量梯度值和优化计算的拟合结果返回至VB控件中,并将优化后分子总能量、能量梯度值和优化计算的拟合结果写入结果文件B中进行储存;
步骤六、储存优化后的分子结构:
采用HyperChem选择分子结构另存为指定文件夹下的优化后的分子结构文件;
步骤七、完成剩余分子结构的优化:
利用VB的判断语句,判断步骤二中名称变量的赋值是否与名称储存文件A中最后一个化合物名称一致,若一致则优化程序结束,跳出循环;若不一致,则利用循环语句重复步骤二至步骤七,直至完成剩余分子结构的优化。
2.根据权利要求1所述高效批量优化分子结构的方法,其特征在于步骤二中,在VB的循环语句中,读取分子结构之前,利用VB,通过DDE会话,实现VB和HyperChem之间的通信,VB发出指令,操纵HyperChem选择设置选项,设置分子力学场;之后,利用VB读取化合物名称储存文件A中某化合物的名称,将名称赋值给VB中的名称变量,同时,通过DDE会话发出指令,操纵HyperChem打开步骤一建立的数据库所在路径下,该名称变量对应的化合物分子结构文件,显示在HyperChem的软件界面上。
3.根据权利要求1所述高效批量优化分子结构的方法,其特征在于步骤三中,利用VB,通过DDE会话,发出指令,操纵HyperChem计算分子结构的单点能;然后,将计算得到的分子总能量和能量梯度值,通过DDE会话,返回至VB控件中,显示在VB窗体中的控件上,同时,利用VB将分子总能量和能量梯度值写入结果文件B中进行储存。
4.根据权利要求1所述高效批量优化分子结构的方法,其特征在于步骤四中,利用VB,通过DDE会话,发出指令,操纵HyperChem选择分子结构优化选项,在步骤二设置的分子力学方法下进行分子结构预优化,预优化之后,将预优化后分子总能量、能量梯度值和优化计算的拟合结果,通过DDE会话,返回至VB控件中,显示在VB窗体中的控件上,同时,利用VB将预优化后分子总能量、能量梯度值和优化计算的拟合结果写入结果文件B中进行储存。
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