[发明专利]一组用于髓母细胞瘤分子分型的基因及其应用有效
| 申请号： | 201811043820.3 | 申请日： | 2018-09-07 |
| 公开（公告）号： | CN109182517B | 公开（公告）日： | 2020-12-04 |
| 发明（设计）人： | 徐清华;陈成书;孙益丰;陈金影;王奇峰;宋凯斌 | 申请（专利权）人： | 杭州可帮基因科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6837;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人： | 王函 |
| 地址： | 311100 浙江省杭州市余杭区钱*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一组 用于 细胞 分子 基因 及其 应用 | ||
1.一组用于髓母细胞瘤分子分型的基因，其特征在于，为如下13个基因：EPHA7基因、OTX2基因、ROBO1基因 、TTR基因、LGR5基因、IGF2BP3基因、TBR1基因、ZFPM2基因、TRDC基因、TRAC基因、PEX5L基因、NKD1基因、RALYL基因；所述髓母细胞瘤分子分型为WNT型、SHH型、Group3型和Group4型。
2.如权利要求1所述的基因，其特征在于，所述基因采用如下方法筛选得到：采用“大数据和算法驱动”的分析技术，选取对于髓母细胞瘤高特异性的基因组合；首先构建髓母细胞瘤基因表达谱数据库，包含人类已知20250个基因、461例样品，近1000万个数据点，将每个样本中人类2万多个基因的表达量数据与样本的临床数据关联起来，然后通过统计分析方法方差检验来筛选髓母细胞瘤特异基因，即分析每个基因与髓母细胞瘤分子亚型的相关性，并将关联度最高的基因提取出来作为特征基因，最终筛选得到13个基因用于构建分类模型。
3.一组用于髓母细胞瘤分子分型的基因，其特征在于，为如下24个基因：GABRA5基因、GAD1基因、TNC基因、KCNA1基因、EOMES基因、MAB21L2基因、WIF1基因、DKK2基因、PDLIM3基因、IMPG2基因、KHDRBS2基因、EPHA7基因、OTX2基因、ROBO1基因 、TTR基因、LGR5基因、IGF2BP3基因、TBR1基因、ZFPM2基因、TRDC基因、TRAC基因、PEX5L基因、NKD1基因、RALYL基因；所述髓母细胞瘤分子分型为WNT型、SHH型、Group3型和Group4型。
4.如权利要求3所述的基因，其特征在于，所述基因采用如下方法筛选得到：采用“大数据和算法驱动”的分析技术，选取对于髓母细胞瘤高特异性的基因组合；首先构建髓母细胞瘤基因表达谱数据库，包含人类已知20250个基因、461例样品，近1000万个数据点，将每个样本中人类2万多个基因的表达量数据与样本的临床数据关联起来，然后通过统计分析方法方差检验来筛选髓母细胞瘤特异基因，即分析每个基因与髓母细胞瘤分子亚型的相关性，并将关联度最高的基因提取出来作为特征基因，最终筛选得到24个基因用于构建分类模型。
5.检测如权利要求1-4任一项所述的一组用于检测髓母细胞瘤分子分型的基因的试剂在制备用于髓母细胞瘤分子分型的试剂盒中的应用。
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