[发明专利]一种基于rs81469622位点的基因型鉴定猪背膘厚的方法及应用

说明书

本发明公开了一种基于rs81469622位点的基因型鉴定猪背膘厚的方法。本发明提供了一种鉴定或辅助鉴定猪背膘厚性状的方法，是检测待测猪基于rs81469622位点的基因型，TT基因型的猪的背膘厚＞CT基因型的猪的背膘厚＞CC基因型的猪的背膘厚。rs81469622位点为如下(Ⅰ)或(Ⅱ)：(Ⅰ)猪基因组第18号染色体第11121298位核苷酸；(Ⅱ)猪基因组中序列表的序列1所示DNA区段的第26位核苷酸。rs81469622位点对猪活体背膘厚有显著影响，可作为分子遗传标记，寻找与其相关或紧密连锁的影响背膘厚数量性状基因座，以对猪直接进行基因型选择或标记辅助选择，从而加快猪优势品种的选育。

技术领域

本发明属于基因工程领域，具体涉及一种基于rs81469622位点的基因型鉴定猪背膘厚的方法。

背景技术

我国是生猪养殖大国，也是猪肉消费大国。猪肉在诸多肉类产品中的比重一直保持在三分之一左右，是人们比较喜爱的副食之一。随着人们生活水平不断提高，人们的饮食习惯也有所改变，对蛋白含量高的瘦猪肉需求越来越大。因此，培育出优质的瘦肉型猪，成为了研究的热点。

背膘厚属于猪的胴体性状，容易测量和计算。背膘厚数值反映了猪肉脂肪含量的多少，背膘厚数值低表示猪肉的脂肪含量少，瘦肉率高；反之，背膘厚数值高表示瘦肉率低。因此，在生产和育种过程中十分重视对膘薄性状的选择。

随着分子生物学的发展，分子标记辅助选择在猪育种中发挥越来越重要的作用，大大加快了育种进程。单核苷酸多态性(SNP)是育种中运用较多的分子标记方法，主要思路是通过候选基因确定研究基因SNP位点，在确定基因的SNP位点后通过测序或酶切等方法进行SNP分型，获得不同个体在DNA水平的差异，然后通过关联分析，从而得到具有指导育种实践的基因型个体。

发明内容

本发明的目的是提供一种基于rs81469622位点的基因型鉴定猪背膘厚的方法。

本发明提供了一种鉴定或辅助鉴定猪背膘厚性状的方法，是检测待测猪基于rs81469622位点的基因型，TT基因型的猪的背膘厚＞CT基因型的猪的背膘厚＞CC基因型的猪的背膘厚。

检测待测猪基于rs81469622位点的基因型的方法为如下(a1)或(a2)：

(a1)直接测序；

(a2)以待测猪的基因组DNA为模板，采用特异引物对进行PCR扩增，然后对扩增产物进行测序；所述特异引物对的靶序列中具有rs81469622位点。

所述特异引物对由引物F和引物R组成；

所述引物F为如下(a1)或(a2)：

(a1)序列表的序列2所示的单链DNA分子；

(a2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；

所述引物R为如下(b1)或(b2)：

(b1)序列表的序列3所示的单链DNA分子；

(b2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子。

本发明还保护一种特异引物对，由引物F和引物R组成；

所述引物F为如下(a1)或(a2)：

(a1)序列表的序列2所示的单链DNA分子；

(a2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；

所述引物R为如下(b1)或(b2)：

(b1)序列表的序列3所示的单链DNA分子；