[发明专利]一种荧光扩增曲线阴阳性判定方法及装置有效
申请号: | 201811105648.X | 申请日: | 2018-09-21 |
公开(公告)号: | CN109161584B | 公开(公告)日: | 2021-07-06 |
发明(设计)人: | 杨晓慧;王宝杰;辛娟;周慧;石磊;王磊;邢婉丽;程京 | 申请(专利权)人: | 博奥生物集团有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12M1/34 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 王宝筠 |
地址: | 102206 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 荧光 扩增 曲线 阴阳 判定 方法 装置 | ||
1.一种荧光扩增曲线阴阳性判定方法,其特征在于,该方法包括:
生成荧光扩增曲线的斜率分布曲线;
所述荧光扩增曲线的斜率分布曲线的公式为:
其中,y′iy′i为曲线在第i点处的斜率值,y(i+1)与yi为原始曲线在第i+1点和第i点的y值,即荧光值,x(i+1)和xi为曲线在第i+1点和第i点处的x值,即时间值;
基于所述斜率分布曲线,计算获得斜率峰值和扩增倍数;
所述斜率峰值的计算公式为:Gmax=max{y′0,y′1,...,y′n-1};
其中,y′0、y′1......y′n-1为曲线在各个点的斜率值;
所述扩增倍数的计算公式为:
其中,为使用算术平均法计算以曲线极大值为核心的N点平均值,为以曲线极小值为核心的N点平均值,N取值范围为3~7的奇数;max为曲线最大值处的x坐标值,min为曲线最小值处的x坐标值;
根据阳性对照曲线的形态,对扩增倍数的第一阈值和第二阈值进行修正,获得修正后的第一阈值和修正后的第二阈值;所述根据阳性对照曲线的形态,对扩增倍数的第一阈值和第二阈值进行修正,获得修正后的第一阈值和修正后的第二阈值,包括:当检测指标为阳性对照指标时,将所述第一阈值和所述第二阈值分别确定为修正后的第一阈值和修正后的第二阈值;当检测指标为非阳性对照指标时,获取阳性对照曲线的基线;判断所述基线是否小于预设阈值,如果是,则将所述第一阈值和所述第二阈值分别确定为修正后的第一阈值和修正后的第二阈值;
计算获得所述斜率峰值和所述扩增倍数的乘积;
若所述乘积大于预设最大阈值,判断所述荧光扩增曲线的扩增倍数是否大于所述修正后的第一阈值,若是,则将所述荧光扩增曲线确定为阳性,否则将所述荧光扩增曲线确定为阴性;
若所述乘积大于预设最小阈值,且所述乘积小于预设最大阈值,判断所述荧光扩增曲线的扩增倍数是否大于所述修正后的第二阈值,若是,则判断所述荧光扩增曲线的斜率峰值是否大于预设斜率阈值,如果是,则将所述荧光扩增曲线确定为阳性,否则将所述荧光扩增曲线确定为阴性;
若所述乘积小于预设最小阈值,则将所述荧光扩增曲线确定为阴性。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述生成荧光扩增曲线的斜率分布曲线之前,该方法还包括:
对所述荧光扩增曲线进行预处理,获得处理后的荧光扩增曲线,其中,所述预处理包括平滑处理和滤波处理。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于所述斜率分布曲线,计算获得斜率峰值和扩增倍数,包括:
计算获得所述斜率分布曲线在各个点的斜率值;
在所述各个点的斜率值确定斜率最大值,将所述斜率最大值记为斜率峰值;
基于所述斜率分布曲线,计算获得荧光信号强度最大值的第一均值,并获得起始荧光信号强度最小值对应的第二均值;
计算所述第一均值和所述第二均值的比值,将所述比值记为扩增倍数。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括:
若所述阳性对照曲线为阴性,则将所述第一阈值和所述第二阈值分别确定为修正后的第一阈值和修正后的第二阈值;
若所述阳性对照曲线为阳性,计算获得所述阳性对照曲线的扩增倍数;
若所述扩增倍数大于预设扩增阈值,且小于第一阈值,则将所述扩增倍数作为修正后的第一阈值;
若所述扩增倍数大于预设扩增阈值,且小于第二阈值,则将所述扩增倍数作为修正后的第二阈值。
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