[发明专利]一种肠道病毒组的高通量检测方法及应用

权利要求书

1.一种肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于：所述方法以Kraken自带的病毒库为基础，建立现有样本数据库的肠道病毒组分注释平台和肠道病毒组分分析平台，肠道组分分析平台分析肠道组分注释平台获得的数据并构建肠道病毒数据集，基于肠道病毒数据集构建预测模型，对未知样本利用高通量测序的数据和建立的预测模型，对样本分类进行预测并判断其是否高血压和高血压阶段。

2.根据权利要求1所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于，所述肠道病毒组分注释平台为对收集到的数据库样本进行处理的平台，所述处理包括：数据质控处理、混合拼装、基因和蛋白质预测、病毒蛋白的鉴定和病毒组分的含量计算。

3.根据权利要求1所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于，所述肠道病毒组分分析平台为分析数据库中已知样本信息的平台，已构建高血压肠道病毒数据集，所述分析包括：不同组别之间的病毒生物标志物分析，样本的病毒型分析和细菌与病毒之间的网络分析。

4.根据权利要求3所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于，所述的高血压肠道病毒数据集的构建过程包括：

i.对病毒数据样本进行混合拼装，获得长度不低于1000bp的片段；

ii.对步骤i中获得的长序列片段进行开放阅读框预测，获得对应的基因序列和蛋白序列；

iii.对步骤ii中获得的基因序列和蛋白序列进行去冗余处理，获得非冗余的基因和蛋白数据集；

iv.以Kraken自带的病毒库为依据对步骤iii中获得的非冗余基因和蛋白数据集进行鉴定，获得高血压肠道病毒数据集。

5.根据权利要求1所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于，现有样本包括三组：健康对照样本组、高血压前期样本组和高血压样本组。

6.根据权利要求5所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于：对三组现有样本的宏基因数据进行混合拼装，每组20个样本。

7.根据权利要求1所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于：预测模型的构建采用机器学习中的随机森林方法进行。

8.根据权利要求7所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于：预测模型采用R语言进行构建。

9.根据权利要求1所述的肠道病毒组的高通量检测方法，其特征在于，采用bowtie对未知样本的宏基因组DNA进行打断、加接头，进行高通量测序。

10.一种肠道病毒组的高通量检测方法的应用，其特征在于：所述检测方法采用根据权利要求1～9任一项所述的肠道病毒组的高通量检测方法检测待测样本血压是否达到阈值。