[发明专利]一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统有效
申请号: | 201811135738.3 | 申请日: | 2018-09-28 |
公开(公告)号: | CN109061020B | 公开(公告)日: | 2020-08-07 |
发明(设计)人: | 贾伟;陈天璐;谢国祥;梁丹丹 | 申请(专利权)人: | 深圳市绘云生物科技有限公司 |
主分类号: | G01N30/86 | 分类号: | G01N30/86;G01N30/02 |
代理公司: | 中山市科企联知识产权代理事务所(普通合伙) 44337 | 代理人: | 杨立铭 |
地址: | 518109 广东省深圳市龙华区龙华*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 色谱 平台 数据 分析 系统 | ||
1.一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,包括:
液相色谱-质谱原始数据预处理模块,其通过调用‘metaMS’R包中的‘runLC()’函数,用于完成液相色谱质谱原始数据的预处理;
气相色谱-质谱原始数据预处理模块,其通过调用函数对气相色谱质谱原始数据进行预处理;
物质鉴定模块,其提供自建库和公共库数据,并用于对气质数据和液质数据进行成分鉴定,输入为经液相色谱-质谱原始数据预处理模块和气相色谱-质谱原始数据预处理模块处理后的峰列表文件和/或质谱信息,输出为鉴定后的峰列表、筛选后的峰列表及物质详情文件;
数据调理模块,其用于对预处理数据进行数据清洗、调理和转换,输入所述鉴定以及筛选后的峰列表文件,输出处理后的峰列表文件;
统计分析模块,其提供单维和多维统计分析方法,并用于对数据分析,输入所述处理后的峰列表文件,输出统计分析详情和差异物筛选结果文件;
通路分析和富集分析模块,其将代谢物与人类代谢组数据库、京都基因与基因组百科全书、有机小分子生物活性数据库进行整合分析,得到化合物相应的ID号码、详细信息和通路信息;
控制中心模块,其分别与所述液相色谱质谱原始数据预处理模块、所述气相色谱质谱原始数据预处理模块、所述物质鉴定模块、所述数据调理模块、所述统计分析模块、所述通路分析和富集分析模块串口连接,并用于接收和处理数据信号。
2.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述控制中心模块包括简化流程模块,所述简化流程模块为所述控制中心模块提供一键式快捷分析指令。
3.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述液相色谱质谱原始数据的预处理包括:色谱峰提取、峰分组、保留时间校正和缺失值填充。
4.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述气相色谱质谱原始数据预处理方式包括:第一,通过调用‘metaMS’R包中的‘runGC()’函数,完成峰提取、伪谱鉴定及伪谱删除;
第二,通过调用‘eRah’R包,完成峰识别、峰解卷积、峰对齐和缺失值填充。
5.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述公共库数据对比时,仅利用代谢物的质荷比进行比对;自建库对比时,可保留时间与质荷比作为双重衡量标准进行物质鉴定。
6.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述数据调理模块包括:异常值替换、零值填充、数据归一化、基本统计量计算、行求平均值、数据提取、数据转换和转置。
7.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,
所述单维统计分析涵盖配对与非配对、参数与非参数的多种检验方法,并提供三种P值矫正方法:具体包括t-检验、方差分析、Wilcoxon符号秩和检验、KruskalWallis检验;
所述多维统计分析包括:主成分分析法、正交偏最小二乘法、支持向量机法、随机森林法和Biosigner生物标志物判别分析法。
8.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述通路分析和富集分析模块分析目标代谢物与特定生理或病理状态的关联和可能的作用以及其所在代谢通路或网络的重要性和富集情况。
9.如权利要求2所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述简化流程模块提供基本的数据分析和挖掘流程,包括气相色谱质谱数据预处理、液相色谱质谱数据预处理、数据调理、统计分析、通路和富集分析。
10.如权利要求1所述的一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统,其特征在于,所述一种基于气相/液相色谱质谱平台的数据分析系统还包括:受试者工作特征曲线分析、线性回归及相关分析、层次聚类、亚层次聚类分析、作图工具、合并LECO CSV文件、样本量及效能分析。
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