[发明专利]一种抗原表位的检测方法、系统及终端设备有效
| 申请号： | 201811153746.0 | 申请日： | 2018-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN109326324B | 公开（公告）日： | 2022-01-25 |
| 发明（设计）人： | 羊红光;智杏娟;成彬;柳凌云 | 申请（专利权）人： | 河北省科学院应用数学研究所 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00 |
| 代理公司： | 石家庄国为知识产权事务所 13120 | 代理人： | 张贵勤 |
| 地址： | 050081 河北*** | 国省代码： | 河北;13 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 抗原 检测 方法 系统 终端设备 | ||
1.一种抗原表位的检测方法，其特征在于，包括：
获取训练样本和待检测蛋白质序列，所述训练样本包括表位样本和非表位样本，所述表位样本为包含抗原表位的蛋白质序列，所述非表位样本为未包含抗原表位的蛋白质序列；
分别提取所述表位样本的特征向量和所述非表位样本的特征向量；
利用所述表位样本的特征向量和所述非表位样本的特征向量对标准神经网络模型进行训练，得到预测神经网络模型；
提取所述待检测蛋白质序列的特征向量，并将所述待检测蛋白质序列的特征向量输入至所述预测神经网络模型中，得到对应的抗原表位检测结果；
其中，所述提取所述表位样本的特征向量，包括，
提取所述表位样本的位置特征向量；
提取所述表位样本的理化特征向量；
将所述位置特征向量和所述理化特征向量进行组合，得到所述表位样本的特征向量；
具体的，所述提取所述表位样本的位置特征向量，包括，
获取所述表位样本包含的氨基酸的种类；
统计每一种氨基酸在所述表位样本中的位置信息；
根据所述每一种氨基酸的位置信息生成对应的位置向量；
对所述每一种氨基酸的位置向量进行归一化处理得到对应的概率向量，具体为：根据得到一种氨基酸在所述表位样本中第i次出现的概率值，将所述一种氨基酸对应的所有概率值进行排列，生成所述一种氨基酸对应的概率向量；
根据所述每一种氨基酸的概率向量计算对应的位置熵，具体为：根据计算所述一种氨基酸的位置熵，h表示所述一种氨基酸的位置熵；
将所有种类的氨基酸对应的位置熵进行排列，生成所述表位样本的位置特征向量；
其中，di为所述一种氨基酸在所述表位样本中第i次出现的位置信息，c为所述一种氨基酸在所述表位样本中出现的总次数，pi为所述一种氨基酸在所述表位样本中第i次出现的概率值。
2.如权利要求1所述的抗原表位的检测方法，其特征在于，所述理化特征向量包括亲水特征向量；
所述提取所述表位样本的理化特征向量，包括：
获取所述表位样本中的每个氨基酸的亲水度；
将所有氨基酸的亲水度进行排列，得到所述亲水特征向量。
3.如权利要求1所述的抗原表位的检测方法，其特征在于，所述理化特征向量包括疏水特征向量；
所述提取所述表位样本的理化特征向量，包括：
获取所述表位样本中的每个氨基酸的疏水度；
将所有氨基酸的疏水度进行排列，得到所述疏水特征向量。
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