[发明专利]一种融合的TaqDNA聚合酶及其应用有效
申请号: | 201811172475.3 | 申请日: | 2018-10-09 |
公开(公告)号: | CN109266628B | 公开(公告)日: | 2020-04-14 |
发明(设计)人: | 张晨曦;吴晓渊;张斌 | 申请(专利权)人: | 南京市胸科医院 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C12N15/54;C12N15/70;C12N1/21;C12Q1/686;C12R1/19 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 杜静 |
地址: | 210029 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 融合 taqdna 聚合 及其 应用 | ||
为实现上述目的,本发明公开一种融合的Taq DNA聚合酶,其为DNA单链结合蛋白Sac7d或DNA单链结合蛋白sso7d分别与野生型Taq DNA聚合酶融合而成。本发明提供的一种融合的Taq DNA聚合酶,增强了扩增过程中与模板链的亲和能力从而提高扩增效率,实现困难模板的扩增,且酶活性稳定,可以直接用血液当模板进行扩增。
技术领域
本发明涉及生物工程领域,具体涉及一种融合的Taq DNA聚合酶及其应用。
背景技术
PCR是分子生物学领域最基本但是最重要的方法,它可以将微量的核酸复制扩大,实现生物学上的研究,大大促进了分子生物学和相关学科的发展。PCR的主要成分包括:反应Buffer、酶、dNTP、模板、引物。这些组分中,每个组分都是PCR扩增不可缺少的,但DNA聚合酶是实现DNA复制的关键,目前针对这些不同的组分,研究者关注最多的是酶的研究,期望通过对酶的改造,实现更多应用,比如:血液直扩、土壤直扩、植物直扩等。
Taq DNA聚合酶存在于水生嗜热菌(Thermus aquaticus)的嗜热DNA聚合酶,可在74℃复制DNA,在95℃仍具有酶活力。该酶可在离体条件下,以DNA为模板,延伸引物,合成双链DNA。其在结构上由三部分构成:DNA聚合酶区、3’核酸外切酶区和5’核酸外切酶区,只有5’→3’DNA聚合酶活性和5’→3’的外切酶活性,缺少3’→5’的外切酶活性。Taq DNA聚合酶是重要的生物技术工具酶,广泛应用于疾病诊断与治疗、传染病检测、药物作用机理等医药领域。
随着医药科技的发展,对Taq酶性能的要求不断提高,野生型的Taq DNA聚合酶已经不能满足特殊PCR技术的要求了,例如用于定点突变时要求聚合酶有较高的保真性,用于长片段扩增时要求聚合酶有较高的扩增效率。由此而带来了多种酶的改造方法,比如:通过制备酶单分子纳米凝胶提高酶的稳定性(化学修饰);定点突变置换氨基酸,如3’端核酸外切酶区的氨基酸变化使其失去5’→3’的外切功能(分子修饰)等等。目前常用的改造方法有定点突变、定点缺失、基因融合等。
当前对Taq DNA聚合酶改造用的最多的是聚合酶联合应用、定点突变、缺失突变等,通过定向改变氨基酸种类,达到增强某种性能的目的。例如:Taq DNA聚合酶缺乏校正功能,所以将Taq DNA聚合酶和Pfu DNA聚合酶联合应用,利用Taq DNA聚合酶较强的延伸能力和Pfu DNA聚合酶的校正功能,使得扩增可以达到40kb。例如:将Taq DNA聚合酶543位的丝氨酸定点突变为天冬酰胺,可以增强Taq DNA聚合酶和模板引物复合物的相互作用,提高了对高GC含量等困难模板的扩增能力。
很多报道通过酶改造增强了Taq DNA聚合酶的扩增效率、扩增特异性等,但是很少有报道提高了Taq DNA聚合酶在不经过纯化的DNA,实现直接用血液进行扩增。当下用于医院或者工业用户的扩增都是样本数量庞大,如果要先进行DNA提取纯化,再进行扩增,一方面需耗费很长的时间,另一方面DNA交叉污染可能出现很多假阳性,不利于结果的判定。
发明内容
针对上述现有技术存在的问题,本发明目的提供的一种融合的Taq DNA聚合酶,增强了扩增过程中与模板链的亲和能力从而提高扩增效率,实现困难模板的扩增,且酶活性稳定,可以直接用血液当模板进行扩增。
为实现上述目的,本发明提供一种融合的Taq DNA聚合酶,其为DNA单链结合蛋白Sac7d或DNA单链结合蛋白sso7d分别与野生型Taq DNA聚合酶融合而成。
本发明所述的野生型Taq DNA聚合酶的编码序列优选如SEQ ID NO.3所示。
本发明所提供的融合的Taq DNA聚合酶,编码基因序列如SEQ ID NO.1或SEQ IDNO.2所示的核苷酸序列。
所述的核苷酸序列还可以为SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列进行1个或几个核苷酸取代而得到的密码子同义突变的核苷酸序列。
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