[发明专利]BRCA1基因g.43063754T＞G突变体及其引物

说明书

本发明公开了一种BRCA1基因g.43063754T>G突变体及其引物，本发明属于基因工程及肿瘤医学领域。该BRCA1基因突变与BRCA1正常基因序列相比具有g.43063754T>G位点突变，包括一种用于检测该突变体的特异性引物、包含该特异性引物的试剂盒以及该突变体在乳腺癌辅助诊断中的应用。本发明提供了乳腺癌致病的新突变位点，可用于早期诊断乳腺癌。

技术领域

本发明属于基因工程及肿瘤医学领域，具体涉及一种BRCA1基因g.43063754T＞G突变体及其引物。

背景技术

乳腺癌是女性常见的恶性肿瘤之一，它严重威胁女性健康。已有研究显示约有5～10％的乳腺癌病例是发生于携带有自体显性遗传且高外显率的乳腺癌易感基因突变者，相关基因有BRCA1、BRCA2、p53、PTEN、ATM等。乳腺癌易感基因包括高外显率易感基因、中外显率易感基因和低外显率易感基因。其中，BRCAl和BRCA2基因是最主要的高外显率易感基因，也是目前研究最为确切的与乳腺癌发生相关的两个基因，表现出明显的家族遗传倾向。BRCAl和BRCA2基因都是抑癌基因。BRCAl基因定位于染色体17q21区域，基因大小为81.19kb，共有24个外显子。BRCAl基因富含Alu重复序列，上游5’端存在假基因序列。BRCA2基因定位于染色体13q12-13区域，基因大小为84.19kb，共有27个外显子。BRCA2基因富含AT。BRCAl蛋白由1863个氨基酸残基组成，N端RING结构域，中部含有核定位序列，即NLS；C端包含BRCTl和BRCT2结构域。BRCA2蛋白由3418个氨基酸残基组成，其11号外显子编码8个BRC模体，通过该模体有助于BRCA2蛋白与RAD51蛋白相互结合，修复损伤双链DNA。它们编码的蛋白都是同源重组系统中参与DNA双链损伤修复的重要组成成分，也通过参与细胞周期监测、转录调控及染色质重塑来维持基因组的稳定性。

大量研究证明携带有这两个基因致病性突变的妇女终生患乳腺癌的风险显著升高。据估计，携带有BRCAl基因突变的妇女到70岁时患乳腺癌的累积风险达到65～87％；而携带有BCRA2基因突变的妇女到70岁时患乳腺癌的累积风险为45～84％。此外，这两个基因的突变也可能增加其他一些恶性肿瘤的发病危险度。因此一些发达国家已经开展了对于适当选择的病人进行的遗传咨询和遗传检测，并对检测到的突变携带者给予早期筛查与预防干预。因此有必要对中国高危乳腺癌人群中这两个基因的变异情况有一个全面的认识，建立一个快速、准确的筛查检测方法，制定关于中国妇女的遗传筛查指南，以便于在特定人群中早期发现、早期预防并最终降低乳腺癌的发病率。

发明内容

发明目的：为了克服现有技术中存在的不足，本发明提供一种BRCA1基因g.43063754T＞G突变体、检测该突变体的特异性引物、包含该特异性引物的诊断试剂盒和该突变体在乳腺癌辅助诊断中的应用，以实现快速方便的辅助判断乳腺癌。

技术方案：为实现上述目的，本发明的一种BRCA1基因g.43063754T＞G突变体，其野生型BRCA1基因DNA序列如SEQ ID NO:1所示，其突变型BRCA1基因DNA序列如SEQ ID NO:2所示。

进一步的，一种用于检测所述BRCA1基因g.43063754T＞G突变体的特异性引物，所述特异性引物的上游引物序列如为SEQ ID NO:3所示，下游引物序列如SEQ ID NO:4所示。

进一步的，一种乳腺癌辅助诊断试剂盒，包括用于检测所述BRCA1基因g.43063754T＞G突变体的特异性引物。

进一步的，一种BRCA1基因g.43063754T＞G突变体在乳腺癌辅助诊断中的应用，利用外周血通过权利要求3所述一种乳腺癌辅助诊断试剂盒检测BRCA1基因g.43063754T＞G位点突变，再通过突变位点谱辅助判断乳腺癌；所述一种乳腺癌辅助诊断试剂盒检测BRCA1基因g.43063754T＞G位点突变的具体步骤如下，

(1)提取全血基因组DNA；