[发明专利]基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法及系统

说明书

本发明公开了基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法及系统，包括以下步骤：S1从数据库中获取药物以及药物靶标相关数据信息，并同时整合不同来源数据；S2将收集的不同来源数据进行标准化处理，并根据数据类别构建药物信息表单；S3根据药物信息表单的键值，将所有数据进行关联，构建药物综合信息库模型。本发明有益效果：用户能够非常直观便捷的获取关注药物或靶标相关的信息；通过药物和药物靶标实现查询和结果的可视化关联展示。

技术领域

本发明涉及药物信息学、生物信息学和化学信息学领域，具体来说，涉及基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法及系统，系统地整合药物相关的信息资源、提供交互式药物信息检索系统。

背景技术

随着药物信息学以及信息科学的发展，挖掘已有药物的新适应症（旧药新用或药物重定位）逐渐成为国际上被广泛采用的研发策略，具有更高的投入产出效率，因此也成为众多国际制药企业重视和采用的一种方式；由于已上市药物的药物动力学以及安全性资料较为详尽，新用途的开发能很快能进行Ⅱ期临床评估，据评估可节约大概 40% 的研发费用，并可大幅度缩短研发周期，能够在一定程度上有效规避研发风险、降低整体成本、加快药物上市的步伐，从而迅速满足临床用药需求；挖掘已有药物新的适应症（旧药新用或药物重定位）策略正从依赖临床观察的经验性研究，朝着基于医药大数据分析的系统性研究转变，综上所述，寻找高效的药物研发新策略或新资源成为当务之急。

目前，互联网上涌现了大量丰富的药物信息资源，且日益成为我国药学领域广大教学、科研人员获取学术信息的重要渠道，但网上的各种药学资源分别存储在不同国家、不同地区的服务器，缺乏集中统一的管理机制，整体上处于一种分散的状态，这种高度的自由性和开放性网络资源虽然为网上药学信息资源的发展提供了前所未有的机遇，但因为缺乏必要的过滤和质量控制机制，造成了网上药学资源优劣俱存、良莠不齐等问题，导致用户查找存在检准率低、针对性差、冗余信息太多等问题，使用起来事倍功半。

针对相关技术中的问题，目前尚未提出有效的解决方案。

发明内容

针对相关技术中的上述技术问题，本发明提出一种基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法及系统，能够为医药工作者提供一个更加高效便捷的获取药物自身及其关联信息的途径，为他们节约大量的宝贵时间，有利于临床、科研和教学任务的顺利展开。

为实现上述技术目的，本发明的技术方案是这样实现的：

一种基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法，包括以下步骤：

S1从数据库中获取药物以及药物靶标相关数据信息，并同时整合不同来源数据；

S2将收集的不同来源数据进行标准化处理，并根据数据类别构建药物信息表单；

S3根据药物信息表单的键值，将所有数据进行关联，构建药物综合信息库模型。

进一步地，所述步骤S1中获取药物以及药物靶标相关数据信息的过程需从对应数据库中下载对应的药物关联数据文件，并对获得的文件进行解析和清洗，提取所需的信息。

进一步地，所述步骤S1中整合不同来源数据，去除重复字段和冗余信息内容，对其缺失的信息进行补全。

进一步地，所述步骤S1中数据库包括但不限于drugbank、chembl、TCMID、pubchem、SMPDB和KEGGdrug。

进一步地，所述步骤S2中药物信息表单包括但不限于小分子药物基本信息表、中药信息表、靶标数据信息表、靶标分类数据信息表和药物-靶标相互作用信息表。

进一步地，所述步骤S3中将构建药物综合信息库模型进行展示，其中，展示页面包括但不限于药物识别信息、药物特性、药理信息、毒理信息、药物药物相互作用信息、参考网站外链接信息和药物靶标的网络展示。