[发明专利]一种基于扩增子测序检测染色体杂合性缺失的试剂盒及方法

权利要求书

1.一种基于扩增子测序检测染色体1p19q杂合性缺失的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒含有44对引物对混合物，所述44对寡核苷酸引物对混合物由SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：88所示序列的引物组成。

2.根据权利要求1所述的基于扩增子测序检测染色体1p19q杂合性缺失的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒含有20个标签引物，分别为SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：96、SEQ IDNO：97、SEQ ID NO：98、SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：100、SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：102、SEQID NO：103、SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：105、SEQ ID NO：106、SEQ ID NO：107、SEQ ID NO：108所示序列。

3.根据权利要求1所述的基于扩增子测序检测染色体1p19q杂合性缺失的试剂盒，其特征在于：还包含GC稳定剂、PCR酶混合物、纯化磁珠、ddH₂O。

4.根据权利要求2所述的基于扩增子测序检测染色体1p19q杂合性缺失的试剂盒，其特征在于，所示试剂盒能够用于确定基于染色体1p19q杂合性缺失的烷化剂化疗和放疗联合烷化剂化疗方案，包括：

（1）从肿瘤样本中分离DNA；

（2）以分离到的DNA为模板，使用所述试剂盒中的44对引物对混合物进行PCR扩增并获得第一次PCR扩增产物；

（3）将第一次PCR扩增产物纯化后，根据样本数量，采用所述试剂盒中的标签引物SEQID NO：89～SEQ ID NO：96和SEQ ID NO：97～SEQ ID NO：108进行随意组合为引物对，并且对第一次PCR扩增产物的纯化产物进行第二次PCR扩增；

（4）将第二次PCR扩增产物纯化后，进行质量检测；

（5）对第二次PCR扩增产物纯化后的产物进行测序，并分析测序结果；

（6）根据测序结果，对染色体上的每一个待检测区段的RAEDS数量进行统计；

（7）以长臂RAEDS/短臂RAEDS或短臂RAEDS/长臂RAEDS的比值确定基于染色体1p19q杂合性缺失的烷化剂化疗和放疗联合烷化剂化疗方案。