[发明专利]一种用于胶质瘤中预后评价及化疗效果预测的干扰素相关试剂盒有效
申请号: | 201811221911.1 | 申请日: | 2018-10-19 |
公开(公告)号: | CN109182527B | 公开(公告)日: | 2022-03-01 |
发明(设计)人: | 吴安华;程文;朱晨;邹存义;管格非 | 申请(专利权)人: | 中国医科大学附属第一医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 沈阳亚泰专利商标代理有限公司 21107 | 代理人: | 史力伏 |
地址: | 110001 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 胶质 预后 评价 化疗 效果 预测 干扰素 相关 试剂盒 | ||
1.一种用于胶质瘤中预后评价及化疗效果预测的干扰素相关试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含能够测定胶质瘤组织中干扰素相关模型五基因SOCS3、ISG20、NLRC5、IRF9、IFIT5表达量的相关试剂,包括:SOCS3、ISG20、NLRC5、IRF9和IFIT5的上下游引物,作为内参的GAPDH的上下游引物,以及RNA提取试剂:Trizol、异丙醇、氯仿、无水乙醇,反转录试剂,SYBR Green聚合酶链式反应体系:PCR缓冲液、荧光染料、dNTPs、无RNA酶、水;
所述干扰素模型的建立方法具体步骤如下:
1)选取132个干扰素相关基因,通过单因素COX分析筛选出五个同预后相关的基因,并根据每个基因的表达值及回归系数建立了风险模型,评分公式为:风险值= (0.1730 xSOCS3 表达量) + (0.2370 x ISG20 表达量) + (-0.4303 x IFIT5 表达量) + (-0.2914x NLRC5 表达量) + (-0.2829 x IRF9 表达量);
2)选取6个公共数据库中的胶质母细胞瘤患者,分别根据风险值的中位值将患者分为高风险组和低风险组,结果显示该模型具有稳定的预后指导价值,即高风险组生存期显著短于低风险组,该风险模型同样适合于低级别胶质瘤患者以及具体细化的不同层次不同亚群患者;并且高风险值提示存在化疗抵抗;
3)将该模型同常规的胶质瘤独立预后因素包括KPS及放疗、化疗联合起来预后准确性进一步提高;
4)将该模型转化为试剂盒。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒用于胶质瘤中预后评价及化疗效果预测的使用方法如下:
1)选取合适大小新鲜患者组织标本,充分研磨、抽提RNA;
2) 反转录成cDNA模板;
3) 筛选组成干扰素模型的五个基因及GAPDH的特异性引物,进行实时定量PCR;
4) 以内参GAPDH为参照,记录每个反应的Ct值,检测结果以ΔCt表示,其中ΔCt=Ct目的基因-CtGAPDH,最终算出五个目的基因相对于内参GAPDH的表达倍数1/2ΔCt;
5) 代入表达式,胶质母细胞瘤中截点为评分大于4.1定义为高风险组;小于4.1 定义为低风险组;对于低级别胶质瘤患者,截断值为-6.2,评分大于-6.2定义为高风险组;小于-6.2 定义为低风险组。
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