[发明专利]大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403、引物及应用

说明书

本发明公开了一种大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，yau403与CRd基因紧密连锁，可用于芸薹种包括结球白菜和青梗菜抗根肿病基因的分子标记辅助选择。在辅助选择过程中同时使用这些标记，选择理论准确度可达到100％，并且该标记重复性好，可靠性高，检测成本低，省时省力。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403、引物及应用。

背景技术

本课题组对大白菜自交系‘85-74’进行了抗病性鉴定，研究表明该抗病材料抗芸薹根肿菌生理小种4，进一步研究证明抗根肿病基因为显性单基因，并命名为CRd。(Pang等，Identification and mapping of the clubroot resistance geneCRdin Chinesecabbage(Brassica rapassp.pekinensis)，Front.Plant Sci.9:653.)。

在芸薹种抗根肿病品种转育过程中，每代都需要采用田间接种根肿病菌的方法鉴定中间材料的基因型，而且环境条件会影响到正确中间材料的选择，这样势必影响转育进程，因此抗病品种转育难的问题还没有彻底解决。分子标记辅助选择技术(MAS)可能是最终解决这一问题的有效途径。

目前，国内沈阳农业大学朴钟云课题组获得了与芸薹种抗根肿病基因CRb连锁的标记(2004,2014)，包括TCR01，TCR05和TCR09，见(Piao等，SCAR and CAPS mapping ofCRb,a gene conferring resistance to Plasmodiophorabrassicae in Chinesecabbage(Brassica rapa ssp.pekinensis)，以及TCR108、TCR30、TCR74、TCR79，见(Zhang等，Fine genetic and physical mapping of the CRb gene conferring resistance toclubroot disease in Brassica rapa.，Mol Breeding，34:1173-1183)。但这些标记都是与CRb基因有关的标记，目前为止，并未发现与CRd基因有关的标记。

发明内容

本发明的目的是提供一种大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403、引物及应用，利用该分子标记可对待测植株进行苗期鉴定，从而减少连锁累赘，简化大白菜抗根肿病品种的转育程序。

本发明提供了一种大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403，所述大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，为：

5’-TGTCACCAGCGCATTATAGCATTGCTCCCCTCATTAAAAAGCACAGCCACAAAGCTTCCATTTTTATTCTTACAAAATTATTATCATTCAGACCAAACTGAAAAAAGGAAGAGAGAGAAGGGGATTCATCATCAACCCATCTTCCCTCCCTT-3’。

本发明还提供了一种上述大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403的PCR特异性扩增引物，包括：

F yau403:5’-TGTCACCAGCGCATTATAGC-3’

R yau403:5’-CAACCCATCTTCCCTCCCTT-3’。

本发明还提供了一种大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403在分子标记辅助选择中的应用。

本发明还提供了一种大白菜抗根肿病CRd基因的紧密连锁分子标记yau403在大白菜抗根肿病分子标记辅助选择中的应用。