[发明专利]检测莲草直胸跳甲OR基因转录水平的引物及方法有效
申请号: | 201811231572.5 | 申请日: | 2018-10-22 |
公开(公告)号: | CN109182549B | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 傅建炜;何肖云;郑丽祯;李建宇;史梦竹;林凌鸿;王秋月 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350003 福建省福州市鼓楼*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 莲草直胸跳甲 or 基因 转录 水平 引物 方法 | ||
1.一种检测莲草直胸跳甲OR基因转录水平的荧光定量PCR引物,其特征在于:包括符合荧光定量PCR反应特点的上下游引物:
OR-F:5`-ATCCTTACTCAATTCTGGACTTCC-3`,
OR-R:5`-TGCTTATCTCATGCTGGACAA-3`。
2.一种采用权利要求1所述引物检测莲草直胸跳甲OR基因转录水平的荧光定量PCR方法,其特征在于:按如下步骤:
(1)cDNA第一链合成:提取样本的总RNA并纯化,采用反转录试剂盒得到以提取的RNA为模板反转录得到的cDNA;
(2)对下述引物进行常规PCR检测
该基因的荧光定量上下游引物:
OR-F:5`-ATCCTTACTCAATTCTGGACTTCC-3`;
OR-R:5`-TGCTTATCTCATGCTGGACAA-3`;
以及作为内参基因的上下游引物:
Tubulin-F: 5`-AGATGTCCGCCACCTTCA-3`;
Tubulin-R: 5`-GCCTCTTGGTATTGTTGGTATTCA-3`;
常规PCR扩增体系为25µL:10×buffer 2.5µL ,dNTP 1.0µL,上游引物0.5µL,下游引物0.5µL,100ng/µL cDNA模板1.0µL,Ex-TaqE 0.15µL,水19.35µL;
常规PCR反应程序为:94℃预变性5 min,然后94℃变性30 s, 56℃退火30 s, 72℃延伸1 min,此条件下35个循环,最后72℃再延伸10min;
(3)实时荧光定量PCR反应:
以步骤(1)得到的cDNA为模板,加入步骤(2)所述的引物,进行荧光定量PCR反应,每个样品设置3个重复,扩增后取平均值;
实时荧光定量PCR扩增体系为:SYBR® Premix Ex TaqTM12.5µL,上游引物0.5µL,下游引物0.5µL,100ng/µL cDNA 1.0µL,补足水至25µL;
实时荧光定量PCR反应程序为:95℃预变性 30 s,然后95℃变性5 s 、60℃退火30 s,40个循环。
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